Objectif
Research objectives and content
Calmodulin is a calcium binding protein ( 148 residues) which can respond to changes in calcium concentration and cause activation of a number of important enzymes. High resolution structures have been reported for calmodulin complexed with target peptides from muscle myosin light chain kinases and calmodulin kinase II. These show the 'canonical' structure of a largely helical peptide embedded between the two domains of calmodulin. In the case of the phosphofructokinase, the regulation is unusual in that Ca2+ -calmodulin causes inhibition of the enzyme. Peptides from its target sequence for calmodulin binding have been synthesised and Circular Dichroism studies of their complexes with calmodulin suggest that these peptides have a different mode of interaction: the characterisation of this conformation could provide the first high resolution structural evidence of a target conformation other than the canonical form.
The object of this project is to determine the conformation of the bound peptides and the structure of their binding sites using multidimensional Nuclear Magnetic Resonance methods (including isotopic editing techniques) on calmodulin-peptide complexes. Labelled (15N/ 13C) calmodulin has already been prepared and a detailed set of multidimensional NMR experiments will be carried out to determine the constraints required to calculate the structures of the complexes.
Training content (objective, benefit and expected Impact)
Learning to use apply modern multidimensional Nuclear Magnetic Resonance techniques for examining protein-ligand complexes and for determining their structures. Methods for examining multiligand binding will be learnt. Circular Dichroism and other spectroscopic techniques will also be used. Links with industry / industrial relevance (22)
There is no direct links with industry but the project could provide overall improvements in methods of studying and understanding protein-ligand complexes in solution which could be of general interest to the pharmaceutical industry.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences chimiques chimie inorganique métal alcalinoterreux
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines enzyme
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Données non disponibles
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
NW7 1AA LONDON
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.