Obiettivo
Research objectives and content
Calmodulin is a calcium binding protein ( 148 residues) which can respond to changes in calcium concentration and cause activation of a number of important enzymes. High resolution structures have been reported for calmodulin complexed with target peptides from muscle myosin light chain kinases and calmodulin kinase II. These show the 'canonical' structure of a largely helical peptide embedded between the two domains of calmodulin. In the case of the phosphofructokinase, the regulation is unusual in that Ca2+ -calmodulin causes inhibition of the enzyme. Peptides from its target sequence for calmodulin binding have been synthesised and Circular Dichroism studies of their complexes with calmodulin suggest that these peptides have a different mode of interaction: the characterisation of this conformation could provide the first high resolution structural evidence of a target conformation other than the canonical form.
The object of this project is to determine the conformation of the bound peptides and the structure of their binding sites using multidimensional Nuclear Magnetic Resonance methods (including isotopic editing techniques) on calmodulin-peptide complexes. Labelled (15N/ 13C) calmodulin has already been prepared and a detailed set of multidimensional NMR experiments will be carried out to determine the constraints required to calculate the structures of the complexes.
Training content (objective, benefit and expected Impact)
Learning to use apply modern multidimensional Nuclear Magnetic Resonance techniques for examining protein-ligand complexes and for determining their structures. Methods for examining multiligand binding will be learnt. Circular Dichroism and other spectroscopic techniques will also be used. Links with industry / industrial relevance (22)
There is no direct links with industry but the project could provide overall improvements in methods of studying and understanding protein-ligand complexes in solution which could be of general interest to the pharmaceutical industry.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze chimiche chimica inorganica metalli alcalino terrosi
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine enzimi
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Dati non disponibili
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
NW7 1AA LONDON
Regno Unito
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.