Objectif
The Dean lab has recently cloned Arabidopsis (VAN) genes that mediate vernalization, the low temperature-induced promotion of flowering. Their structure and action on expression of their downstream target, FLC, suggest that they function analogously to Drosophila Polycomb-Group genes, thus explaining the epigenetic basis of vernalization. The parallels between Arabidopsis VAN and Drosophila Polycomb-Group gene suggest that the VAN proteins will act in a multi-subunit complex that binds to specific DNA sequences to maintain a transcriptionally silent chromatin state. To further investigate the molecular basis of vernalization, the objectives of the proposed work will be:
1) To characterize the proteins interacting with VRN2. This objective will be achieved through the use of affinity purification of protein complexes, the components of which will be identified using tryptic peptide fingerprinting and MALOI ToF/Q-Tof analysis
2) To test whether VRN2 bind directly to FLC. This will be achieved with gel-shift and BIACORE assays using purified recombinant VRN2 protein and sub clones covering FLC and flanking genomic sequences. If binding is detected actual binding sites will be determined using in vitro footprint analysis. The in vivo relevance of these sites will be confirmed by analysis of site-directed mutants in transgenic plants. If FLC is not a direct target we will use SELEX to define preferred DNA-binding sites to aid future target identification. The project that I will develop during this post-doctoral position should allow me to acquire new skills in the field of protein biochemistry especially the techniques associated with proteomics. Moreover the program involves a genetic approach in order to evaluate the function of the candidate genes. The acquisition of these techniques is of high interest to main the near future in order to secure a permanent position back in France.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines protéomique
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Données non disponibles
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Données non disponibles
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
NR4 7UH NORWICH
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.