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CORDIS - Forschungsergebnisse der EU
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Inhalt archiviert am 2024-05-21

Molecular determination of the epigenetic basis of vernalization

Ziel

The Dean lab has recently cloned Arabidopsis (VAN) genes that mediate vernalization, the low temperature-induced promotion of flowering. Their structure and action on expression of their downstream target, FLC, suggest that they function analogously to Drosophila Polycomb-Group genes, thus explaining the epigenetic basis of vernalization. The parallels between Arabidopsis VAN and Drosophila Polycomb-Group gene suggest that the VAN proteins will act in a multi-subunit complex that binds to specific DNA sequences to maintain a transcriptionally silent chromatin state. To further investigate the molecular basis of vernalization, the objectives of the proposed work will be:
1) To characterize the proteins interacting with VRN2. This objective will be achieved through the use of affinity purification of protein complexes, the components of which will be identified using tryptic peptide fingerprinting and MALOI ToF/Q-Tof analysis
2) To test whether VRN2 bind directly to FLC. This will be achieved with gel-shift and BIACORE assays using purified recombinant VRN2 protein and sub clones covering FLC and flanking genomic sequences. If binding is detected actual binding sites will be determined using in vitro footprint analysis. The in vivo relevance of these sites will be confirmed by analysis of site-directed mutants in transgenic plants. If FLC is not a direct target we will use SELEX to define preferred DNA-binding sites to aid future target identification. The project that I will develop during this post-doctoral position should allow me to acquire new skills in the field of protein biochemistry especially the techniques associated with proteomics. Moreover the program involves a genetic approach in order to evaluate the function of the candidate genes. The acquisition of these techniques is of high interest to main the near future in order to secure a permanent position back in France.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Daten nicht verfügbar

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

Daten nicht verfügbar

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

RGI - Research grants (individual fellowships)

Koordinator

JOHN INNES CENTRE
EU-Beitrag
Keine Daten
Adresse
Colney Lane - Norwich Research Park
NR4 7UH NORWICH
Vereinigtes Königreich

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Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten
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