Obiettivo
The Dean lab has recently cloned Arabidopsis (VAN) genes that mediate vernalization, the low temperature-induced promotion of flowering. Their structure and action on expression of their downstream target, FLC, suggest that they function analogously to Drosophila Polycomb-Group genes, thus explaining the epigenetic basis of vernalization. The parallels between Arabidopsis VAN and Drosophila Polycomb-Group gene suggest that the VAN proteins will act in a multi-subunit complex that binds to specific DNA sequences to maintain a transcriptionally silent chromatin state. To further investigate the molecular basis of vernalization, the objectives of the proposed work will be:
1) To characterize the proteins interacting with VRN2. This objective will be achieved through the use of affinity purification of protein complexes, the components of which will be identified using tryptic peptide fingerprinting and MALOI ToF/Q-Tof analysis
2) To test whether VRN2 bind directly to FLC. This will be achieved with gel-shift and BIACORE assays using purified recombinant VRN2 protein and sub clones covering FLC and flanking genomic sequences. If binding is detected actual binding sites will be determined using in vitro footprint analysis. The in vivo relevance of these sites will be confirmed by analysis of site-directed mutants in transgenic plants. If FLC is not a direct target we will use SELEX to define preferred DNA-binding sites to aid future target identification. The project that I will develop during this post-doctoral position should allow me to acquire new skills in the field of protein biochemistry especially the techniques associated with proteomics. Moreover the program involves a genetic approach in order to evaluate the function of the candidate genes. The acquisition of these techniques is of high interest to main the near future in order to secure a permanent position back in France.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine proteomica
- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Dati non disponibili
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Dati non disponibili
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
NR4 7UH NORWICH
Regno Unito
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.