Objectif
Major goal of the proposed project is to understand how protein kinases identified recently in 26S proteasome-associated SCF ubiquitin ligase complexes control the stability of essential regulatory factors, and thereby major developmental and hormonal signaling pathways in plants. In collaboration with the host institute, we have found that all thus far known subunits of glucose/sucrose and stress regulated SnRK protein kinases are present in an SCF ligase complex that controls the stability of IAA/AUX transcription factors, which regulate cellular responses to the plant hormone auxin. Using biochemical and immunological methods, we aim to characterize the SnRK protein kinase-SCF-proteasome complexes by i) studying their interaction with IAA/AUX and other substrate proteins and ii) identifying their yet unknown regulatory subunits using MALDI-Q-TOF mass spectrometry. Our preliminary data show that, in addition to SnRK, the proteasome associated SCF ubiquitin ligases can also interact through theirSkp1 subunits with other signaling protein kinases. Therefore, we aim to use a systematic proteomics approach based on epitopetagging of multiple SCF-subunits to biochemically characterize their associated protein kinase partners and to link their function to defined developmental and hormonal signaling pathways using a functional genomics approach, which is based on the identification of insertional mutations in genes encoding components of these regulatory complexes. The proposed research project is based on an interdisciplinary approach, which includes a wide scale of modern proteomics technologies, extending from protein immunoaffinity labeling, immunoaffinity chromatography, protein interaction studies, massspectrometry and immunocytology to molecular genetic approaches using transgenic plant and cell cultures, sequenced-based mutant screening approaches and advanced classical genetic studies. The applicant brings into the host laboratory specific expertise in protein biochemistry and analytics and is offered with an extensive training in molecular genetic technologies. This interdisciplinary combination of expertise is required for successful combination of proteomics with functional genomics approaches and expected to lead to a better understanding how conserved eukaryotic protein kinases control the SCF-mediated ubiquitination and proteasomal degradation of essential regulatory factors in major signaling pathways of plants.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines protéomique
- sciences naturelles sciences biologiques génétique mutation
- sciences naturelles sciences chimiques chimie analytique spectrométrie de masse
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Données non disponibles
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Données non disponibles
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
50829 KOELN
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.