Cel
Major goal of the proposed project is to understand how protein kinases identified recently in 26S proteasome-associated SCF ubiquitin ligase complexes control the stability of essential regulatory factors, and thereby major developmental and hormonal signaling pathways in plants. In collaboration with the host institute, we have found that all thus far known subunits of glucose/sucrose and stress regulated SnRK protein kinases are present in an SCF ligase complex that controls the stability of IAA/AUX transcription factors, which regulate cellular responses to the plant hormone auxin. Using biochemical and immunological methods, we aim to characterize the SnRK protein kinase-SCF-proteasome complexes by i) studying their interaction with IAA/AUX and other substrate proteins and ii) identifying their yet unknown regulatory subunits using MALDI-Q-TOF mass spectrometry. Our preliminary data show that, in addition to SnRK, the proteasome associated SCF ubiquitin ligases can also interact through theirSkp1 subunits with other signaling protein kinases. Therefore, we aim to use a systematic proteomics approach based on epitopetagging of multiple SCF-subunits to biochemically characterize their associated protein kinase partners and to link their function to defined developmental and hormonal signaling pathways using a functional genomics approach, which is based on the identification of insertional mutations in genes encoding components of these regulatory complexes. The proposed research project is based on an interdisciplinary approach, which includes a wide scale of modern proteomics technologies, extending from protein immunoaffinity labeling, immunoaffinity chromatography, protein interaction studies, massspectrometry and immunocytology to molecular genetic approaches using transgenic plant and cell cultures, sequenced-based mutant screening approaches and advanced classical genetic studies. The applicant brings into the host laboratory specific expertise in protein biochemistry and analytics and is offered with an extensive training in molecular genetic technologies. This interdisciplinary combination of expertise is required for successful combination of proteomics with functional genomics approaches and expected to lead to a better understanding how conserved eukaryotic protein kinases control the SCF-mediated ubiquitination and proteasomal degradation of essential regulatory factors in major signaling pathways of plants.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka proteomika
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka mutacja
- nauki przyrodnicze nauki chemiczne chemia analityczna spektrometria mas
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Brak dostępnych danych
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Brak dostępnych danych
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Koordynator
50829 KOELN
Niemcy
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.