Ziel
Major goal of the proposed project is to understand how protein kinases identified recently in 26S proteasome-associated SCF ubiquitin ligase complexes control the stability of essential regulatory factors, and thereby major developmental and hormonal signaling pathways in plants. In collaboration with the host institute, we have found that all thus far known subunits of glucose/sucrose and stress regulated SnRK protein kinases are present in an SCF ligase complex that controls the stability of IAA/AUX transcription factors, which regulate cellular responses to the plant hormone auxin. Using biochemical and immunological methods, we aim to characterize the SnRK protein kinase-SCF-proteasome complexes by i) studying their interaction with IAA/AUX and other substrate proteins and ii) identifying their yet unknown regulatory subunits using MALDI-Q-TOF mass spectrometry. Our preliminary data show that, in addition to SnRK, the proteasome associated SCF ubiquitin ligases can also interact through theirSkp1 subunits with other signaling protein kinases. Therefore, we aim to use a systematic proteomics approach based on epitopetagging of multiple SCF-subunits to biochemically characterize their associated protein kinase partners and to link their function to defined developmental and hormonal signaling pathways using a functional genomics approach, which is based on the identification of insertional mutations in genes encoding components of these regulatory complexes. The proposed research project is based on an interdisciplinary approach, which includes a wide scale of modern proteomics technologies, extending from protein immunoaffinity labeling, immunoaffinity chromatography, protein interaction studies, massspectrometry and immunocytology to molecular genetic approaches using transgenic plant and cell cultures, sequenced-based mutant screening approaches and advanced classical genetic studies. The applicant brings into the host laboratory specific expertise in protein biochemistry and analytics and is offered with an extensive training in molecular genetic technologies. This interdisciplinary combination of expertise is required for successful combination of proteomics with functional genomics approaches and expected to lead to a better understanding how conserved eukaryotic protein kinases control the SCF-mediated ubiquitination and proteasomal degradation of essential regulatory factors in major signaling pathways of plants.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine Proteomik
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Mutation
- Naturwissenschaften Chemiewissenschaften analytische Chemie Massenspektrometrie
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Daten nicht verfügbar
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Daten nicht verfügbar
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Koordinator
50829 KOELN
Deutschland
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.