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PHIDIAS: Phenotyping with a High-throughput, Intelligent, Distributed, and Interactive Analysis System

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Una base de datos de fenotipos global para botánicos

Un equipo de científicos de la Unión Europea ha completado un sistema de recolección y análisis de datos que acopia, clasifica y almacena datos de fenotipos a partir de imágenes de plantas.

Economía digital

El fenotipo acerca de información acerca de la influencia de la genética y de los factores ambientales sobre las plantas. Para la conservación, es fundamental comprender el desarrollo de la planta que determina el fenotipo observado, pero el análisis fenotípico es un procedimiento complejo. Ante esta situación, los artífices de la iniciativa financiada con fondos europeos PHIDIAS (PHIDIAS: Phenotyping with a high-throughput, intelligent, distributed, and interactive analysis system) se propusieron desarrollar sistemas de imágenes de software y hardware así como un sistema interactivo de procesamiento de datos manejado por el usuario que recibe información de científicos de cualquier parte del mundo. Para el acopio de datos, PHIDIAS desarrolló métodos de detección que utilizaron software de código libre y tecnología de cámaras fáciles de encontrar en el mercado. Gracias a ello, fue posible contar con un sistema de captura de imágenes económico, capaz de producir imágenes compuestas de alta resolución necesarias para estudios de fenotipos. Los científicos han cargado y registrado cientos de imágenes de laboratorios de fenotipos de vegetales, que facilitarán el reconocimiento de características fenotípicas específicas por parte del sistema. Otro aspecto del proyecto se centró en formas de comprimir archivos de imágenes a tamaños más fáciles de manejar. Combinado con software de código abierto y equipamiento económico, el sistema PHIDIAS será de gran utilidad y fácil de personalizar. Gracias a las soluciones de PHIDIAS, los científicos del mundo podrán realizar contribuciones a una base de datos internacional en crecimiento y acceder a herramientas analíticas sofisticadas. Además, con las soluciones de PHIDIAS será posible que los científicos de regiones con dificultades financieras y tecnológicas participen también en este trabajo a escala mundial.

Palabras clave

Base de datos de fenotipos, plantas, botánicos, PHIDIAS, detección, software de código libre

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