La sincronización temporal de la expresión génica
Los factores de transcripción (TF) son la clave en la dicotomía entre la expresión o la no expresión génica. Por medio de la unión a regiones concretas del ADN, los TF controlan la transcripción de información genética de ADN a ARN. Para poner en marcha los niveles de regulación de la expresión génica, los factores de transcripción se unen a unos módulos reguladores de ADN no codificante denominados módulos cis-reguladores (CRM). Cuando se trabaja con los CRM, uno de los problemas es que estos tienden a variar en la composición de secuencias de ADN no codificante. Aunque este hecho no afecta a su papel en la célula, sí que interfiere en la identificación de las secuencias de ADN no codificante de los CRM. Descifrar estos códigos o secuencias de ADN permitirá identificar nuevas dianas farmacológicas para modular la expresión del ADN. Los socios del proyecto financiado por la Unión Europea CISREGLOGIC desarrollaron herramientas informáticas para identificar ortólogos de los CRM, que son secuencias derivadas de un ancestro común. Además, se desarrolló un ingenioso método para aislar y seleccionar las secuencias deseadas. Dos parientes lejanos de la clase Ascidiaceae (los tunicados) fueron objeto de la técnica de la huella filogenética. Estas especies se encuentran suficientemente alejadas filogenéticamente como para identificar los CRM en base al alineamiento no codificante. Después, un programa informático identificó los CRM candidatos para genes concretos en cada especie y su posición aproximada en el genoma. Para identificar los lugares de unión de los TF, se empleó un nuevo sistema de puntuación de la afinidad. Los investigadores también idearon un método para eliminar aquellos lugares de unión que registraron una unión menos específica con los TF. Gracias a estas herramientas, se identificaron pares de CRM que podrían ser considerados como ortólogos. Los investigadores demostraron que entre las dos especies se comparten grupos de lugares de unión semejantes en el área de los genes de regulación temprana. Es más, los grupos de lugares de unión semejantes se asociaron con genes con funciones parecidas. Los resultados genómicos del proyecto CISREGLOGIC han proporcionado un importante conocimiento que constituirá la base para posteriores investigaciones. La conversión de estos resultados en productos farmacológicos podría conducir a la modulación de la regulación de la expresión génica, que predispone a sufrir una amplia gama de enfermedades.
Palabras clave
Activación génica, factor de transcripción, módulo cis-regulador, expresión del ADN, diana farmacológica, enfermedad
