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Isolation and characterization of single nucleotide polymorpisms (SNPs) in Atlantic bluefin tuna (Thunnus thynnus)

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Genética de poblaciones del atún rojo

Investigaciones realizadas sobre el genoma del atún rojo del Atlántico derivaron en nuevas herramientas para el estudio de las diferencias entre poblaciones de peces.

Cambio climático y medio ambiente icon Cambio climático y medio ambiente

En el caso del atún rojo del Atlántico (Thunnus thynnus) la sobrepesca es masiva, por lo que debe haber precaución en la gestión del recurso para evitar su extinción. Es necesario un mayor conocimiento y comprensión de la estructura de la población para proteger la especie. El objetivo del proyecto financiado por la Unión Europea ABFT SNP fue desarrollar recursos genéticos para el atún rojo del Atlántico. El objetivo específico de los investigadores fue identificar algunas variaciones en el código genético que podrían utilizarse en la investigación de la variabilidad poblacional. Determinaron la secuencia del transcriptoma (moléculas de ARN que codifican proteínas así como otros ARN no codificantes) de un importante número de individuos. De este modo se encontró gran variación genética en las poblaciones de atún rojo. Esta información de las secuencias se combinó además con conocimientos previos del genoma del atún rojo atlántico identificándose así ciento veintiocho sitios de variación en el ADN relacionados con la variabilidad de las poblaciones. En base a esto se diseñó un chip OpenArray de caracterización del genotipo que permitirá a los usuarios diferenciar fácilmente entre los grupos de poblaciones de atún rojo atlántico. Los investigadores también desarrollaron paneles marcadores para genes específicos e identificaron otros tipos de variaciones en el ADN útiles, tales como las repeticiones de microsatélite. En resumen, gracias al proyecto ABFT SNP se avanzó en la caracterización genética del atún rojo atlántico y se dispone de herramientas para un estudio profundo de la genética de poblaciones en esta especie.

Palabras clave

Genética de poblaciones, atún rojo del Atlántico, gestión de recursos, extinción, polimorfismos mononucleótidos, transcriptoma

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