Genetyka populacji tuńczyka błękitnopłetwego
Atlantycki tuńczyk błękitnopłetwy (ABFT) — Thunnus thynnus — to nadmiernie odławiany gatunek, który wymaga szczególnie ostrożnego zarządzania, aby nie dopuścić do jego wyginięcia. Do ochrony tego gatunku potrzebna jest lepsza znajomość struktury jego populacji. Celem finansowanego ze środków UE projektu ABFT SNP było opracowanie profilu genetycznego ABFT. Uczeni chcieli w szczególności zidentyfikować różne warianty w kodzie DNA, które można by wykorzystać do badania zmienności populacji. Dokonano sekwencjonowania transkryptomu (cząsteczek RNA kodujących białka oraz innych niekodujących RNA) dużej liczby osobników. Odkryto istotne zróżnicowanie genetyczne populacji tuńczyka. Dane z sekwencjonowania połączono także z wcześniej dostępnymi danymi na temat genomu ABFT, co pozwoliło na zidentyfikowanie 128 miejsc w DNA powiązanych ze zróżnicowaniem populacji. Wykorzystano je do zaprojektowania chip do genotypowania OpenArray, który umożliwi użytkownikom łatwe rozróżnianie grup populacji ABFT. Przygotowano też panele markerów dla określonych genów i zidentyfikowano inne przydatne rodzaje odmian DNA, w tym na przykład powtórzenia pojedynczych sekwencji. Podsumowując, projekt ABFT SNP umożliwił dokładniejsze scharakteryzowanie ABFT oraz doprowadził do powstania narzędzi do szczegółowego analizowania genetyki populacji tego gatunku.
Słowa kluczowe
Genetyka populacji, atlantycki tuńczyk błękitnopłetwy, zarządzanie zasobami rybnymi, wyginięcie, polimorfizm pojedynczego nukleotydu, transkryptom
