Une série d'outils pour évaluer la biodiversité des sols
La biodiversité est un facteur important de la qualité d'un sol, surtout avec la pollution et les activités agricoles qui ont tendance à la dégrader. Les nématodes entomopathogènes (NEP) infestent les insectes et sont donc souvent utiles pour contrôler les insectes nuisibles qui s'attaquent aux cultures. Le projet ECOLOGY-EPN-FOOD WEB, financé par l'UE, a mis au point des outils moléculaires qui permettront d'étudier les chaînes alimentaires dans les écosystèmes édaphiques. Les nématodes entomopathogènes sont bien connus et très importants en agronomie, c'est pourquoi les chercheurs s'y sont intéressés, ainsi qu'à d'autres acteurs fréquents de leur chaîne alimentaire. La série d'outils peut identifier plusieurs bactéries qui parasitent ces nématodes. Il reconnaît aussi des nématodes non parasites qui entrent en concurrence avec les NEP, ainsi que quatre des plus courantes espèces de NEP. Des membres du projet ont utilisé la série pour étudier des stratégies courantes de traitement des sols (irrigation, fertilisation et paillage), et pour comparer les chaînes alimentaires entre les sols cultivés et naturels. Ces travaux ont apporté d'importantes informations sur la façon dont les facteurs abiotiques (non vivants) peuvent influencer les chaînes alimentaires dans le sol et donc la productivité des cultures. La série d'outils a aussi servi à étudier les effets des déchets miniers sur les chaînes alimentaires, et notamment sur les NEP. Les chercheurs ont constaté qu'une concentration élevée de plomb avait un fort impact sur la biodiversité des sols, à l'exception de certains nématodes bien adaptés. Le projet ECOLOGY-EPN-FOOD WEB a démontré l'intérêt d'analyser les chaînes alimentaires édaphiques au niveau moléculaire. Il est clair que son kit d'outils peut être appliqué pour étudier divers problèmes de qualité des sols de par le monde.
Mots‑clés
Sol, biodiversité, outils moléculaires, nématodes entomopathogènes, chaîne alimentaire, productivité des cultures, déchets miniers
