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Exploring natural variation of Shade Avoidance Syndrome in Arabidopsis using high-throughput phenotyping and Genome-wide association studies

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Estudio del síndrome de huida de la sombra vegetal

Un equipo de científicos ha creado un método de alto rendimiento y gran sofisticación con el que estudiar las respuestas de los vegetales a cambios en las condiciones de luminosidad.

Los vegetales modifican sus hábitos de crecimiento en función de las condiciones de luz, en lo que se conoce como el síndrome de huida de la sombra (SAS). No obstante, el SAS no se ha estudiado al detalle en vegetales adultos y aún deben aclararse los múltiples aspectos relacionados con el control genético y molecular de este proceso. El proyecto financiado con fondos europeos SAS-ARABIDOPSIS-GWA se propuso crear un sistema de obtención de datos e imágenes sofisticado y de alto rendimiento dedicado al estudio del SAS en Arabidopsis thaliana que, en conjunción con análisis genéticos, generase datos sobre los cambios físicos y químicos que se producen en los vegetales en respuesta a condiciones de luminosidad deficientes. Sus trabajos preliminares se dedicaron al establecimiento del sistema de obtención de imágenes y al flujo de datos. Para ello proporcionaron protocolos de crecimiento estandarizados, programas de ordenador con los que convertir imágenes bidimensionales en puntos de datos tridimensionales y una base de datos en la que almacenar los corpus recabados. Con este sistema se cultivaron y caracterizaron cerca de doscientas plantas. De cada una de ellas se extrajo información genética para ejecutar un estudio de asociación de genoma completo con el que establecer relaciones entre rasgos genéticos y físicos. Los resultados preliminares mostraron que los genes involucrados en el SAS en vegetales jóvenes se dedicaban a otras funciones en los vegetales adultos y permitieron descubrir genes nuevos participantes en el SAS a los que se dedicarán estudios más detallados. El sistema de obtención de imágenes desarrollado en el proyecto posee una precisión elevada y puede resultar útil en muy distintos estudios sobre la fisiología vegetal. En conclusión, el conjunto de resultados científicos de SAS-ARABIDOPSIS-GWA ampliará enormemente el conocimiento que se posee del desarrollo vegetal.

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