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Painting the landscape of translational control of gene expression through meta-analysis of genome wide data sets

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La regulación de la traducción a escala global

Cuando falla la regulación de la expresión génica, la consecuencia puede ser el desarrollo de cáncer. Un nuevo método estadístico está abordando el estudio de la regulación de la traducción a nivel del genoma completo.

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La regulación de la traducción de la expresión génica tiene lugar tras la transcripción y ayuda a determinar cuántas proteínas por ARN mensajero (mARN) se producen. Un defecto en el funcionamiento de este proceso es crítico, para el desarrollo y para la memoria, y contribuye al desarrollo de muchas enfermedades humanas. El proyecto TRANSLATOMICS (Painting the landscape of translational control of gene expression through meta-analysis of genome wide data sets) ha tomado varias medidas novedosas para conformar un enfoque multidisciplinar con el que estudiar la regulación de la traducción. La extracción de datos abarcando una gama amplia de estudios, facilitó información a partir de la cual derivar las reglas y los mecanismos de la regulación de la traducción en el genoma completo. Los investigadores realizaron una búsqueda minuciosa en los repositorios de datos para llevar a cabo comparaciones independientes y descartaron aquellos datos que no cumplían distintos criterios. Los criterios eran la falta de sentido biológico, la incapacidad para mostrar transcripción diferencial después del ajuste de los datos por medio de múltiples análisis y aquellos considerados como no informativos. Tras la identificación de genes transcritos diferencialmente, los investigadores destacaron un conjunto de módulos correguladores que definen la organización de alto nivel de la traducción del mARN. Gracias al análisis de los módulos para determinar su validez, los investigadores encontraron más de un centenar de operones que coordinan la expresión génica. Aplicando perspectivas de redes, los investigadores de TRANSLATOMICS descubrieron entonces un segundo nivel de regulación en el que los módulos no estaban regulados como unidades sino como pares. Puesto que el incremento de la actividad en un módulo va acompañado de una disminución en el otro, se puede lograr homeostasis, por ejemplo. El siguiente paso es vincular estos mecanismos con fenotipos biológicos y con enfermedades, aportando información sobre la naturaleza de la perturbación del mARN. El proceso de identificación de elementos regulatorios del ARN está ya completo y la investigación en lo sucesivo se dedicará a la validación funcional y de alto rendimiento de los módulos regulatorios. Este enfoque tan revolucionario sobre la organización en múltiples niveles de la regulación de la traducción podría dar lugar a terapias nuevas orientadas hacia la normalización de la expresión génica. La desregulación de la traducción está asociada a una gama amplia de cánceres, entre otros elementos. A medida que avance la investigación, es probable descubrir que hay variantes en las regiones regulatorias que contribuyen a la aparición de enfermedades complejas más que los fallos en la producción de proteínas.

Palabras clave

Regulación de la traducción, expresión génica, cáncer, genoma completo, ARNm, enfermedad

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