Más allá de los cambios en el ADN durante la evolución de los primates
El proyecto financiado con fondos europeos PRIMATE_REG_EVOL (A comparative genomic study of the contribution of epigenetic mechanisms to regulatory evolution in primates) estudió la función de la epigenética en la evolución de los primates. Evaluando el papel de reacciones químicas que no son resultado de cambios en el ADN, los investigadores estudiaron cambios epigenéticos en cinco tejidos de tres especies de primates (humanos, chimpancés y macacos). Los mecanismos de regulación de la expresión genética originados por metilación del ADN dan lugar a sistemas de regulación diferencial. Cuando finalice el proyecto, los investigadores esperan disponer de un conjunto completo de datos de expresión genética para los cinco tejidos de las tres especies de primates. Los resultados ofrecerán una magnífica oportunidad para examinar tanto las diferencias que se han conservado a lo largo de la evolución como los genes y las rutas que se han modificado como resultado de la selección natural. Los investigadores emplearon la conversión por bisulfito de todo el genoma para evaluar el estatus de metilación en cuatro tejidos (corazón, riñón, hígado y pulmón) de las tres especies de primates. Este proceso convierte la bases citosina en bases uracilo, pero deja intactas las bases citosina metiladas. La secuenciación de alto rendimiento realizada en los tres primates se analizó con el fin de detectar diferencias entre especies. Empleando la técnica de secuenciación del ARN, los socios del proyecto también recopilaron perfiles de expresión genética para examinar genes y rutas bioquímicas que han cambiado a lo largo de la evolución. La integración y el análisis de los corpus desvelaron aspectos del genoma en los que los cambios en la metilación se relacionan con cambios en la expresión. Un modelo estadístico desarrollado por el equipo científico calcula la proporción de variación en los niveles de expresión génica en distintos tejidos y especies debida a cambios en la metilación. Los datos acumulados y analizados en el proyecto PRIMATE_REG_EVOL permitieron determinar los mecanismos moleculares que explican parte de las diferencias regulatorias que se aprecian en cada especie. Esta labor permite conocer mejor la evolución debida a los cambios en la regulación génica. En conjunto, el trabajo del proyecto PRIMATE_REG_EVOL podría servir como plataforma para estudiar de manera general la evolución a nivel molecular.
Palabras clave
Evolución de los primates, regulación génica, epigenética, metilación, modelo
