Du matériel génétique constamment édité
La fidélité du contenu génomique est compromise par deux mécanismes, principalement l'édition du génome et les rétrotransposons actifs. Même à l'échelle d'une cellule individuelle, ces processus peuvent générer un grand nombre de transcriptions différentes. Le projet GENEDISCREEN (Identification and screen of RNA editing in the human genome), financé par l'UE, s'est penché sur l'étude de ces phénomènes moléculaires mal compris. Pour ce faire, les chercheurs du projet ont étudié avec soin le génome humain et ont comparé des séquences d'ARN à leur ADN original pour découvrir des millions de sites d'éditions inconnus jusqu'à présent. Le nombre de sites d'édition conservés chez les mammifères était relativement faible, et possédait des caractéristiques et une distribution uniques comparées aux sites non conservés. Ces observations ont poussé les chercheurs à avancer que les sites conservés jouent un rôle en biologie chez les mammifères et que l'édition pourrait également influencer de nombreuses maladies. D'autres travaux ont été effectués pour déterminer si l'édition du génome contribue au maintien des rétrotransposons au cours de l'évolution. Les rétrotransposons sont des éléments génétiques capables de sauter d'un site génomique à un autre site et constituent des composants omniprésents de l'ADN de nombreux organismes eucaryotes. Les résultats de l'étude ont démontré que l'édition permet au génome d'utiliser ces séquences transformées à son avantage et atténue principalement la mutagénécité des rétrotransposons. Ce mécanisme antiviral accélère l'évolution des rétrotransposons et de leurs hôtes. Dans un autre volet du projet, les scientifiques ont découvert des taux plus importants d'édition de l'ARN dans des échantillons de cancer par rapport aux tissus normaux. Cette découverte indique que l'édition pourrait interagir avec les altérations génomiques de l'ADN pour déclencher la carcinogenèse. Ainsi, les éditions peuvent servir de candidats pour des applications thérapeutiques et diagnostiques. Dans l'ensemble, les résultats de l'étude GENEDISCREEN offrent une compréhension sans précédent sur les mécanismes d'édition de l'ARN et de l'ADN. Les résultats sur l'édition constante du génome au niveau de l'ADN et de l'ARN sur des millions de sites ont apporté des renseignements sur la diversité génomique au sein d'une cellule individuelle ou d'un organisme.
Mots‑clés
Édition du génome, rétrotransposons, ARN, évolution
