Des ARN non codant régulent les réponses immunitaires
Les récepteurs de type Toll (TLR) reconnaissent des motifs et sont essentiels à la réaction immunitaire face à divers microbes. Les TLR sont exprimés dans les cellules dendritiques, et de récentes études les impliquent dans plusieurs maladies auto-immunes comme le diabète, la maladie inflammatoire de l'intestin, le lupus et l'arthrite rhumatoïde. L'interaction des TLR avec des composants spécifiques d'un pathogène déclenche une transcription qui active les milliers de gènes nécessaires pour alerter le système immunitaire et éliminer le pathogène. Les composants de signalisation amont qui orientent la détection des pathogènes par les TLR sont bien connus, au contraire des cascades de transcription en aval qui contrôlent directement l'expression de gènes spécifiques. Il est important de comprendre les processus moléculaires de la régulation de ces réponses géniques dynamiques. C'est dans ce but que le projet TLR-LNCRNAS (Systematic elucidation of the regulatory roles of large non-coding RNAs in the toll-like receptor pathway), financé par l'UE, a évalué systématiquement le rôle des régulateurs de transcription impliqués dans la réponse des cellules dendritiques à l'activation des TLR. Les scientifiques ont mis au point de nouvelles techniques génomiques au niveau d'une cellule, afin d'identifier les régions régulatrice et les gros ARN non codants (ARNnm) impliqués dans la régulation de la réponse immunitaire découlant de l'exposition à un pathogène. Ils ont associé ces techniques avec des modèles d'hématopoïèse et de réponse immunitaire, obtenant d'importantes informations sur divers mécanismes de régulation relatifs au développement hématopoïétique et aux réactions immunitaires. Les chercheurs ont ainsi identifié un groupe d'ARNnm longs qui régule l'expression génique dans des cellules du système immunitaire naturel suite à la stimulation par un pathogène. Pendant longtemps, ces ARNnm longs ont été considérés comme du «bruit» de transcription, mais de nouveaux indices sont en faveur de leur implication dans divers processus physiologiques. Les outils sophistiqués mis au point durant le projet TLR-LNCRNAS ont permis d'éclaircir divers mécanismes de régulation impliqués dans le développement hématopoïétique et les réactions immunitaires. Ils ont également généré des informations relatives aux points de contrôle immunitaires impliqués dans des pathologies comme le cancer, le diabète et associées aux problèmes d'ordre neurologique ou hématopoïétiques. Sur le long terme, ces études systématiques devraient mettre en relation des mécanismes régulateurs de base avec leurs conséquences physiologiques in vivo pour la santé ou la maladie.
