Niekodujące RNA RZ regulują odpowiedź immunologiczną
Receptor toll-like (TLR) to rodzina receptorów rozpoznających wzorce, która bierze udział w odpowiedzi immunologicznej przeciwko różnym drobnoustrojom. Najnowsze badania, wykonywane na komórkach dendrytycznych, wiążą obecność receptorów TLR z występowaniem różnych chorób, takich jak cukrzyca, zapalenie jelit, toczeń i reumatoidalne zapalenie stawów. Interakcja TLR ze składnikami specyficznymi dla patogenów inicjuje reakcję transkrypcyjną, która aktywuje tysiące genów niezbędnych do ostrzegania adaptacyjnego układu odpornościowego i eliminowania patogenów. Chociaż elementy składowe sygnalizacji w górę, pośredniczące w wykrywaniu patogenów przez TLR są dobrze rozpoznane, niewiele wiadomo na temat kaskad transkrypcyjnych w dół, które bezpośrednio kontrolują specyficzną ekspresję genu. Istotne jest zrozumienie mechanizmów molekularnych leżących u podłoża regulacji tych dynamicznych reakcji genowych. W tym celu powołano projekt, finansowany ze środków unijnych, pod nazwą TLR-LNCRNAS (Systematic elucidation of the regulatory roles of large non-coding RNAs in the toll-like receptor pathway), w trakcie którego systematycznie sprawdzano regulacyjną rolę regulatorów transkrypcyjnych uczestniczących w odpowiedzi komórek dendrytycznych na aktywację TLR. Naukowcy opracowali nowe technologie genomowe dla pojedynczej komórki, które umożliwiają identyfikację obszarów regulatorowych i dużych niekodujących RNA (lncRNA) uczestniczących w regulowaniu efektu immunologicznego po ekspozycji na patogeny. W połączeniu z modelami dla hematopoezy i odpowiedzi immunologicznej, technologie te dostarczyły istotnych informacji na temat różnorodnych mechanizmów regulacyjnych leżących u podstaw rozwój hematopoetycznego i decyzji immunologicznych. Zidentyfikowano podgrupę lncRNAs, która regulowała ekspresję genu we wrodzonych komórkach odpornościowych w reakcji na bodźce patogenowe. Przez długi czas lncRNA uznawano za szum transkrypcyjny, lecz pojawiające się dowody potwierdzają uczestnictwo IncRNA w różnych procesach fizjologicznych. Ogólnie rzecz biorąc, zaawansowane narzędzia powstałe podczas projektu TLR-LNCRNAS pozwoliły na wyznaczenie różnych mechanizmów regulacyjnych związanych z rozwojem hematopoetycznym i decyzjami immunologicznymi. Nowatorskie odkrycie dotyczyło również kontrolnych punktów odpornościowych, mających znaczenie dla procesów usuwania patologii, począwszy od nowotworów po choroby neurologiczne, związane z układem krwiotwórczym i cukrzycę. W dłuższej perspektywie oczekuje się, iż te systematyczne badania pomogą wypełnić lukę pomiędzy podstawowymi mechanizmami regulacyjnymi a ich fizjologicznymi skutkami in vivo w zdrowym i chorym organizmie.
Słowa kluczowe
TLR, komórki dendrytyczne, transkrypcja, TLR-LNCRNAS, IncRNAs
