Vacunas contra el cáncer personalizadas
Un concepto cada vez más aceptado es que el cáncer se trata de un proceso muy dinámico con una gran heterogeneidad genética. Esta circunstancia suele favorecer que los tumores evadan el tratamiento, lo que dificulta seriamente el diseño de vacunas contra el cáncer. Por tanto, para mejorar la eficacia de las vacunas terapéuticas anticancerígenas personalizadas es imprescindible caracterizar pormenorizadamente la heterogeneidad intratumoral. Las vacunas anticancerígenas se diseñan para actuar de manera específica contra mutaciones tumorales concretas exclusivas de un paciente determinado. Un paso clave en el desarrollo de vacunas anticancerígenas personalizadas consiste en identificar variaciones de nucleótido simple (SNV) en el tumor del paciente. Una vez que las SNV son identificadas de manera precisa, los científicos pueden seleccionar los epítopes más inmunogénicos y emplearlos en vacunas terapéuticas. El proyecto financiado por la Unión Europea SCA4PCV desarrolló métodos experimentales y computacionales para estudiar y cuantificar la heterogeneidad intratumoral a fin de mejorar la eficacia de las vacunas anticancerígenas. El equipo de SCA4PCV creó un programa informático avanzado para aplicaciones clínicas destinadas a detectar SNV y analizar la heterogeneidad intratumoral. Este programa emplea una nueva clase de algoritmos estadísticos que permiten llevar a cabo un análisis tremendamente preciso del exoma tumoral. En este sentido, se demostró que la eficacia en la detección de SNP era extrapolable de paciente a paciente, independientemente de la pureza de la muestra del tumor o la complejidad del genoma del tumor. Finalmente, este método se validó exhaustivamente empleando un gran número de muestras, demostrando así su idoneidad para su uso en técnicas clínicas automatizadas de alto rendimiento a gran escala. En otra actividad del proyecto, los investigadores desarrollaron una técnica de imagen de célula única para estimar la eficacia de la clasificación de células individuales mediante citometría de flujo. Este método es necesario para realizar una identificación precisa de subpoblaciones de células cancerígenas. Además, utilizando la microdisección láser, el equipo logró obtener con éxito material genómico de células individuales y poblaciones celulares de secciones de tumores como prueba de concepto para el análisis posterior de la heterogeneidad intratumoral. En conjunto, las herramientas desarrolladas por SCA4PCV favorecen la investigación de la heterogeneidad intratumoral de una manera rentable y precisa. Se espera que la aplicación práctica de estas herramientas mejore el diagnóstico del cáncer, la estratificación de pacientes y la eficacia de las vacunas personalizadas contra el cáncer.
Palabras clave
Vacuna contra el cáncer, inmunoterapia, variaciones de nucleótido simple, heterogeneidad intratumoral, SCA4PCV, programa informático
