Científicos españoles revelan un mapa dinámico de proteínas
Un equipo de científicos españoles ha publicado el primer mapa sobre el comportamiento dinámico de las proteínas. Publicado en la revista científica estadounidense «Proceedings of the National Academy of Sciences», el mapa muestra cómo las proteínas pueden moverse y formar complejos con otras moléculas. El objetivo del equipo de científicos del Instituto de Investigación Biomédica (IRB, Barcelona), el Programa de Ciencias de la Vida del Centro de Supercomputación de Barcelona (BSC) y el Instituto Nacional de Bioinformática (INB) es definir las propiedades dinámicas de las proteínas que les permitan predecir las estructuras que éstas pueden formar basándose en la presencia de ligandos o modificaciones. Éste es el primer estudio realizado en el marco de un amplio proyecto científico destinado a crear una extensa biblioteca de 1.900 proteínas en movimiento con los recursos de MareNostrum, la supercomputadora más potente de Europa. La base de datos, llamada MoDel, permitirá a los usuarios observar cómo se mueven en sus entornos las estructuras en 3D de proteínas representativas. «MoDel tiene como objetivo crear con el tiempo una "cuarta dimensión" de las estructuras de las proteínas, ofreciendo de este modo un panorama completo de posibles estructuras para el proteoma entero (la red completa de interacciones de proteínas en una célula)», declaró el Director del proyecto, Modesto Orozco, del IRB Barcelona. «En un futuro próximo, un bioquímico será capaz de comprender el comportamiento de una proteína o diseñar un medicamento que pueda interactuar con esa proteína, sirviéndose no sólo del conocimiento de una única estructura sino de todo un repertorio que se produce espontáneamente en condiciones fisiológicas», añadió. Los científicos creen que la comprensión de la estructura y dinámica de las proteínas ofrecerá posibilidades para la creación de nuevos medicamentos.
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