Des scientifiques espagnols dévoilent une carte dynamique des protéines
Une équipe de scientifiques espagnols a publié la toute première carte sur le comportement dynamique des protéines. Publiée dans la revue scientifique américaine «Proceedings of the National Academy of Sciences», la carte montre comment les protéines sont en mesure de se déplacer et de former des complexes chimiques avec d'autres molécules. L'objectif de l'équipe de scientifiques de l'Institute for Research in Biomedicine (IRB Barcelona), du Life Sciences Program du Barcelona Supercomputing Center (BSC) et de l'Instituto Nacional de Bioinformática (INB) est de définir les propriétés dynamiques des protéines de façon à leur permettre de prédire les structures qu'elles peuvent former sur la base de la présence de ligands ou de modifications. L'étude est la première d'un projet scientifique plus large destiné à créer une vaste bibliothèque de 1 900 protéines en mouvement, grâce aux ressources du MareNostrum, le super-ordinateur le plus puissant en Europe. Baptisée MoDel, la base de données permettra aux utilisateurs d'observer comment les structures tridimensionnelles des protéines représentatives se déplacent dans leurs environnements. «MoDel vise à créer une "quatrième dimension" des structures protéiques en offrant ainsi progressivement un paysage complet des conformations possibles de l'ensemble du protéome (le réseau complet des interactions protéiques dans une cellule)», a déclaré le directeur du projet, Modesto Orozco, de l'IRB Barcelona. «Dans un avenir proche, un biochimiste sera en mesure de comprendre le comportement d'une protéine, ou de développer un médicament capable d'iinteragir avec cette protéine, en se basant sur la connaissance non seulement d'une structure unique, mais d'un répertoire entier qui se forme spontanément en présence de conditions physiologiques», a-t-il ajouté. Les scientifiques estiment que la compréhension de la structure et de la dynamique des protéines ouvrira des possibilités de développement de nouvelles thérapies.
Pays
Espagne