Hiszpańscy naukowcy przedstawiają dynamiczną mapę białek
Zespół hiszpańskich naukowców opublikował pierwszą mapę dynamicznego zachowania się białek. Mapa, opublikowana w czasopiśmie naukowym "Proceedings of the National Academy of Sciences USA", wskazuje, w jaki sposób białka mogą się poruszać i tworzyć kompleksy z innymi cząsteczkami. Zamierzeniem zespołu naukowców z Instytutu Badań nad Biomedycyną (Institute for Research in Biomedicine - IRB Barcelona) oraz z programu nauk przyrodniczych (Life Sciences Program) w Barcelońskim Ośrodku Superkomputerów (Barcelona Supercomputing Center - BSC) oraz Krajowego Instytut Bioinformatyki (National Institute for Bioinformatics -INB) jest opisanie dynamicznych własności białek, umożliwiające przewidywanie struktur, jakie mogą one tworzyć, na podstawie występowania ligandów czy modyfikacji. Jest to pierwsze badanie w dużym projekcie naukowym, którego celem jest stworzenie rozbudowanej biblioteki dotyczącej 1900 poruszających się białek przy pomocy MareNostrum, najpotężniejszego superkomputera w Europie. Baza danych nazwana MoDel umożliwi użytkownikom zaobserwowanie, w jaki sposób trójwymiarowe struktury reprezentatywnych białek poruszają się w swoim środowisku. - U podstaw opracowania bazy danych MoDel leży stworzenie "czwartego wymiaru" dla struktur białkowych, zapewniając w ten sposób pełną perspektywę potencjalnej struktury przestrzennej całego proteomu (kompletna sieć interakcji białek w komórce) - powiedział dyrektor projektu, Modesto Orozco z IRB Barcelona. - W najbliższej przyszłości biochemik będzie mógł poznać zachowanie białka bądź opracować lek, który wchodzi w interakcję z tym białkiem, z wykorzystaniem nie tylko wiedzy o pojedynczej strukturze, ale także o całej gamie tych struktur samorzutnie pojawiających się w warunkach fizjologicznych - dodał. Naukowcy uważają, że poznanie struktur i dynamiki białek stworzy możliwości opracowania nowych leków.
Kraje
Hiszpania