Des virus naturels pour lutter contre les microbes résistants aux antibiotiques Les bactériophages sont les prédateurs naturels des bactéries. Le projet PhagoPROD, financé par l’UE, sélectionnera et multipliera les bons virus afin de lutter contre le fléau de la résistance aux antibiotiques. Santé © nobeastsofierce, Shutterstock Plus d’un demi-million de personnes meurent chaque année d’infections dues à des bactéries multirésistantes. Plus alarmant encore, les prévisions de l’OMS s’élèvent à 10 millions de morts en 2050. La phagothérapie, l’utilisation de bactériophages comme traitement, est prometteuse, en particulier avec l’arrivée de virus spécialement sélectionnés pour l’attaque et la destruction de nouvelles souches microbiennes. Philippe Rousseau, directeur général administratif chez Pherecydes Pharma, l’entreprise coordinatrice du projet PhagoPROD, financé par l’UE, explique: «L’objectif principal du projet consistait à développer des processus pour la production de phages selon les bonnes pratiques de fabrication (BPF).» L’idée était de transférer ces méthodes à des sous-traitants qualifiés et présélectionnés afin qu’ils produisent des lots de phages selon les BPF pour l’initiation des essais cliniques et des programmes d’accès anticipé afin de traiter les patients à un niveau plus large. Ces programmes favorisent l’accès pré-approuvé aux médicaments pour les patients, en particulier ceux atteints d’une maladie potentiellement mortelle. Faire entrer le «Phagogram» dans l’arène Pherecydes Pharma a développé des produits à base de phages obtenus par la purification et l’amplification de phages naturels. Ces derniers sont actifs contre les principales souches résistantes aux antibiotiques qui représentent une menace considérable pour la santé publique dans le monde: Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, appelée Staphylococcus aureus résistant à la méticilline ou SARM, et Escherichia coli. Dans son approche vers une phagothérapie de précision, l’équipe du projet a également intégré l’objectif de mettre au point une nouvelle version du processus et des outils de production, le «Phagogram» qui mesure l’activité de différents phages sur la souche bactérienne du patient. Le Phagogram permet de développer des traitements propres à chaque patient, ce qui signifie que seuls les virus actifs contre chaque souche lui seront administrés. Dans la conception du traitement, un diagnostic de l’activité est effectué dans un laboratoire afin de déterminer les phages qui seront administrés au patient. Ce processus est en cours et, parallèlement à l’objectif de production BPF, l’équipe travaille sur l’optimisation du Phagogram. «Notre autre objectif consiste à développer une nouvelle version de notre outil Phagogram pour pouvoir examiner davantage d’échantillons plus rapidement et plus près du patient», ajoute Philippe Rousseau. Défis et résilience du projet Avec un projet aussi ambitieux étalé sur trois ans, l’équipe a dû relever de nombreux défis. «L’un des principaux problèmes que nous avons dû surmonter a été de suivre les conseils scientifiques de l’Agence européenne des médicaments quant à la chimie, la fabrication et le contrôle (CMC) des phages», explique Philippe Rousseau. Toutes les étapes du cycle de développement d’un médicament après sa découverte impliquent l’analyse CMC. Durant son développement préclinique, les bonnes méthodes analytiques sont validées pour son suivi. Pour contrer cette difficulté, ils ont dû réinventer quelques processus de production, mettre en place de nouveaux contrôles en partant de zéro, et rassembler un groupe varié de sous-traitants pour produire des lots de phages selon les BPF. En outre, ils ont dû compter encore plus sur les sous-traitants qu’ils ne l’avaient pensé afin de fournir la norme requise de phages. Cela impliquait de les chercher, de les sélectionner et de les former tout en conservant le savoir-faire au sein de leur organisation. Résumant le sentiment de réussite de l’équipe, Philippe Rousseau conclut: «Nous sommes convaincus que nous pouvons fournir des lots de phages BPF pour développer notre processus de phagothérapie de précision. Enfin, nous proposerons de nouveaux traitements aux patients selon leurs besoins.» Mots‑clés PhagoPROD, phages, BPF, Phagogram, phagothérapie, virus, résistant aux antibiotiques
