Des outils de modélisation pour la gestion des coquillages
La moule constitue un élément important de l'activité aquacole européenne en plein essor. Les moules sont des organismes filtreurs et sont, par conséquent, particulièrement sensibles à la contamination de l'écosystème côtier. Mais pour prédire avec précision l'impact des ruissellements agricoles à l'origine de l'eutrophication sur les moules et autres coquillages, des outils de modélisation extrêmement perfectionnés sont nécessaires. C'est ainsi que le programme Energy, Environment and Sustainable Development a financé l'institut néerlandais d'écologie et six autres partenaires afin qu'ils développent un modèle fiable. Le consortium MABENE s'est rapidement retrouvé confronté au problème de savoir comment modéliser simultanément les nombreux processus physiques et biologiques ayant un impact sur les coquillages. En guise de solution, le consortium a décidé de diviser le problème en composants et de développer des modules individuels pour chaque processus. Outre l'hydrodynamique, les turbulences, les vagues, les marées et la dynamique des particules en suspension, des modules ont également été créés pour étudier les cycles et les niveaux de nutriments associés aux phytoplanctons et aux zooplanctons, ainsi que les moules elles-mêmes. Les modules individuels peuvent être interconnectés selon différentes configurations, de manière à permettre à l'utilisateur d'effectuer des simulations en zéro, une, deux ou trois dimensions. Le développement d'algorithmes de complexité diverse pour chaque module a en outre permis d'accroître la flexibilité. Enfin, l'institut néerlandais d'écologie et ses partenaires ont utilisé le concept de source ouverte pour le développement du logiciel. Les outils de modélisation ont été testés avec succès sur trois sites de recherche du consortium MABENE (Limfjorden, au Danemark, Oosterschelde, aux Pays-Bas, et Ria de Vigo, au Portugal), ce qui a permis aux membres du consortium d'acquérir l'expertise et l'expérience nécessaires pour appliquer les outils de modélisation à d'autres régions côtières où foisonnent les coquillages.
