Nueva base de datos útil para quienes investigan con microarreglos
El proyecto TEMBLOR, liderado por la UE, estableció vínculos entre recursos originales a fin de facilitar la investigación que se realiza en toda Europa en el campo de la biología molecular. Su propósito era combinar los logros de los distintos grupos europeos que trabajan en diversos aspectos de la clasificación y descripción de genes y proteínas y, así, mejorar la interoperabilidad de las bases de datos de biología. En el marco de este proyecto, ArrayExpress se diseñó como repositorio público que permite acceder a información relativa a la expresión génica basada en microarreglos. La tecnología de los microarreglos se vale de secuencias creadas por proyectos que trabajan en el genoma y pretende responder a la pregunta de: «¿Qué genes se expresan en un tipo concreto de organismo, en un momento determinado y en determinadas condiciones?». Los microarreglos se encuentran entre los adelantos más importantes realizados jamás en el campo de las ciencias de la vida experimentales. La tecnología implicada en ArrayExpress consiste en la propia base de datos, el cargador de datos y la interfaz de acceso a los mismos. Funciona en Oracle, pero se utilizan muy pocas características especiales de éste, lo que posibilita la transferencia a otras plataformas DBMS (Sistema Administrador de Bases de Datos). Las distintas tablas de la base de datos se han mapeado en relaciones de uno a uno. Además, la información recopilada puede almacenarse en varias tablas. Se efectuaron ciertas modificaciones locales del modelo de objetos para mejorar los resultados en las consultas comunes. Para más información, consulte: http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress
