Analyse par rétrocroisement avancé pour cartographier les gènes de production du lait
Les chercheurs de l'université Ludwig-Maximilians de Munich (Allemagne) ont intégré le matériel génétique provenant d'un cheptel fondateur Red Holstein (RH) dans le génome d'une race pure Fleckvieh (FV). L'objectif des chercheurs était d'intégrer dans le génome FV, les caractéristiques favorables des traits relatifs au rendement laitier et à la qualité des pis en utilisant une stratégie d'introgression des loci de caractères quantitatifs (AB-QTL). Seuls les allèles désirés du génome RH ont été introgressés en laissant le reste du génome FV aussi intact que possible. Les caractéristiques sélectionnées comprennent la production de lait (MY, pour milk yield), et le pourcentage protéique du lait (PP, pour protein percentage). L'équipe de recherche a utilisé des stratégies de sélection par marqueurs afin de détecter les QTL nécessaires et d'exclure les allèles indésirables de l'introgression. Une cartographie complète du génome entier a été effectuée pour neuf traits en utilisant huit familles de descendance uniparentale ayant une taille moyenne de 2134 filles. Après analyse, deux familles ont été exclues des études ultérieures car elles présentaient une trop forte proportion de résultats divergents. Les chercheurs du projet Bovmas ont détecté 22 régions QTL qui affectaient, pour la plupart, les caractéristiques PP et MY simultanément mais à des degrés divers. Les QTL influençant MY et PP ont été identifiés sur le chromosome 10, ce qui prouvait l'existence d'une introgression à partir du cheptel d'origine RH. Les chercheurs ont également trouvé des signes d'introgression de QTL dans quatre régions sur d'autres chromosomes. Les positions de ces QTL sont toutefois des estimations et peuvent encore être affinées par cartographie fine ou par cartographie par intervalle en utilisant la technique de sélection assistée par marqueurs. Une stratégie de recherche a été planifiée en collaboration avec les associations d'éleveurs de Fleckvieh en Autriche et en Bavière et des centres d'insémination artificielle.