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Coordination of resources for conditional expression of mutated mouse alleles

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Vereinheitlichte Datenbank und Kriterien für Mausmodelle erforderlich

Die Maus ist heutzutage der wichtigste Organismus, der bei der Entwicklung von Modellen menschlicher Krankheiten herangezogen wird. Der hier liegende potenzielle langfristige Nutzen erfordert eine standardisierte Herstellung und Verwendung von Mausmutanten.

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Initiativen, die auf die Datenerhebung und die systematische Erzeugung von konditionellen Mausmutanten zielen, greifen auf das Cre-lox-Binärsystem zurück. Obwohl einige Datenbanken bestehende Cre-Treiberlinien anbieten, existieren verschiedene Hindernisse, das Potenzial konditioneller Mutanten vollständig auszunutzen. Das Create-Projekt ("Coordination of Resources for Conditional Expression of Mutated Mouse Alleles") arbeitet daran, diese Hindernisse durch eine Konzentration auf die Verfügbarkeit gut charakterisierter Mauslinien, die Cre-Rekombinase im Gewebe, in Organen und in zellentypenspezifischen Mustern exprimieren, zu beseitigen. Zusammen mit einer International Coordination Group (ICG) brachte die Create-Forschungsgemeinschaft acht Inhaber wichtiger Mausdatenbanken und Forschungsgruppen, die sich mit der konditionellen Mutagenese beschäftigen, zusammen. Das Create-Projekt hat zum Ziel, eine gut kommentierte und integrierte Datenquelle von Cre-Treiberlinien zu schaffen und die Vergrößerung dieser Datenressource zu koordinieren. Die Sammlung, Integration, Vergrößerung und Weitergabe von Cre-Treiberlinien-Datenbanken erfolgt im Rahmen eines vereinheitlichten Webportals mit weltweitem Zugang. Das Datenbank-Zentrum des "European Molecular Biology Laboratory – European Bioinformatics Institute" (EMBL-EBI) hat die Create-Website, bei der das Datenverwaltungssystem BioMart zum Einsatz kommt, entwickelt und öffentlich zugänglich gemacht. Aktivitäten wie gezielte Workshops werden abgehalten, um einen Zeitplan für die Auswahl neuer Technologien und Methoden zu erstellen, um die Cre-vermittelte Rekombination in-vivo zu verbessern, neue Cre-Treiberlinien zu schaffen und zu analysieren, Charakterisierungskriterien zu definieren und die Herstellung der Cre-Treiber in Europa in ähnliche globale Bemühungen zu integrieren. Ein erster diesbezüglicher Erfolg war der erste "CREATE Annual Workshop" und das "ICG Meeting" 2009 im Vereinigten Königreich. Ein weiteres Ziel ist die Bestimmung der Anforderungen der internationalen Maus-Forschungsgemeinschaft. Dies wird durch die Sammlung von Informationen erreicht, die für eine tief greifende Analyse der Mutagenese in verschiedenen Zellen und Gewebetypen erforderlich sind. Das CREATE-Projekt bereitet durch die Durchführung einer Umfrage, aus der Anforderungen und Vorschläge bezüglich neuer Cre-Linien hervorgehen, die Erweiterung der Ressourcen der Cre-Treiber vor. Die Umfrageergebnisse stellen bei der Auswahl der Cre-Treiber, die in nachfolgenden Projekten des Siebten Rahmenprogramms hergestellt werden sollen, das Hauptkriterium dar.

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