De nouvelles molécules pour la chimie génétique
La chimie génétique fait référence à l'étude des systèmes biologiques par altération de leur fonction au moyen de petites molécules. Les bibliothèques de composés soumises aux différents dépistages constituent donc le principal composant de la chimie génétique. Ces tests de dépistage peuvent être, soit phénotypiques dans le but d'identifier la protéine ou le gène responsable (forward genetic ou génétique classique), soit dirigés sur une protéine ou un gène bien spécifique afin d'observer le phénotype résultant (génétique inverse). Pour pouvoir profiter pleinement des avantages qu'apporte la chimie génétique, les scientifiques doivent faire des progrès dans la génération de petites molécules qui soient sélectives pour une protéine et ce, rapidement et à moindre coût. C'est dans cet esprit que le projet européen Multiscaffold («A new strategy for the diversity-oriented synthesis of skeletally diverse alkaloid-like compounds for chemical genetic studies») s'est donné pour tâche la génération de toute une palette de composés de type alcaloïde ayant un squelette (le cœur de la molécule) diversifié. Les partenaires du projet se sont attaqués au procédé complexe de synthèse orientée vers la diversité (DOS, pour diversity oriented synthesis) qui permet la synthèse de petites bibliothèques de molécules organiques dont la structure est plus complexe que celles obtenues par la chimie combinatoire classique. Ces molécules présentent également une plus grande diversité de noyaux structurels. Pour obtenir ces molécules, les chercheurs ont développé une réaction chimique à composants multiples générant 10 noyaux polycycliques différents. Les chimistes ont ensuite examiné le potentiel de transformation de ces noyaux structurels en structures alternatives, c'est-à-dire capables de passer d’une structure à l'autre. Ils ont ainsi pu obtenir une bibliothèque hautement diversifiée d'environ 100 petites molécules de type alcaloïde, offrant toute une palette de variations combinatoires autour de ces noyaux structurels. L'un des résultats les plus significatifs du projet Multiscaffold repose sans doute dans les avancées obtenues dans le domaine de la synthèse orientée vers la diversité. L'utilisation de cette bibliothèque dans des tests génétiques cellulaires et protéiques permettra probablement d'identifier de nouvelles molécules thérapeutiques et de nouveaux médicaments.
