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A European Network for Integrated Genome Annotation

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Organizzare la giungla del genoma

Laboratori europei hanno fatto progressi fondamentali nella mappatura del genoma umano e nella documentazione dei relativi dati. Questi sforzi indipendenti nei singoli paesi devono però essere uniti per il progresso di questo importante settore della sanità e della scienza.

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Informazioni relative al genoma stanno affiorando dai laboratori di tutta Europa, ma la loro distribuzione disparata si sta rivelando controproducente per i ricercatori che vogliono sfruttare i dati più recenti. Il progetto Biosapiens ("A European network for integrated genome annotation"), finanziato dall'UE, ha documentato i laboratori coinvolti e i dati disponibili utilizzando software informatico avanzato e il contributo diretto dei soggetti interessati. Con la rappresentazione di oltre 24 laboratori situati in 14 paesi europei, il progetto ha sviluppato un sofisticato sistema di annotazione distribuita (DAS - Distributed Annotation System) per riunire tutti i dati disponibili. Parallelamente i laboratori coinvolti hanno installato un server DAS e presentato i relativi dati, creando un network formidabile a cui può accedere qualsiasi organizzazione membro. Nel corso del primo anno il progetto ha installato e testato i server in 15 laboratori, aprendo la strada all'adesione di altre realtà. A questi sforzi sono stati associate potenti iniziative di marketing e stampa, nonché workshop e presentazioni per gli scienziati e per il pubblico, al fine di diffondere la conoscenza del network. I risultati più importanti in questo senso sono poi stati pubblicizzati presso altri potenziali partner in tutta Europa e negli Stati Uniti, incoraggiando significativamente gli scambi dinamici tra biologi e ricercatori. Si è anche valutato l'impatto sugli scienziati nuovi membri del progetto, indagando le loro esperienze dell'iniziativa e come fossero proseguiti i loro percorsi professionali dopo di essa. Ciò è stato realizzato tramite un questionario destinato a tutti i ricercatori post-dottorato, creando una solida immagine dell'impatto di Biosapiens oltre il network. Oggi le informazioni formulate sono facilmente accessibili tramite un portale web dedicato, che contribuisce a una maggiore competitività delle piccole e medie imprese (PMI) e incoraggia nuove scoperte. Grazie agli strumenti di formazione e informazione prodotti da Biosapiens, lo sfruttamento dei dati di annotazione del genoma per tutti i biologi in Europa diventerà un dato di fatto.

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