Una plataforma de bioinformática universal e integradora
La biología moderna requiere la integración de datos heterogéneos procedentes de innumerables y diversas fuentes, incluidas las ómicas de alto rendimiento y las más clásicas biología molecular y bioquímica dirigida. La integración efectiva de estos datos dará lugar a un punto de vista de la célula propia de la biología de sistemas. Pese al rápido desarrollo de la bioinformática, que facilita el tratamiento, la validación y la integración de los datos, sigue echándose en falta una forma común e integradora de organizar los conocimientos de los que se dispone. El proyecto financiado con fondos europeos Embrace («Un modelo europeo de educación comunitaria e investigación bioinformática») se puso en marcha con el objetivo primario de relacionar e integrar en una red a grupos europeos existentes dedicados a la informática aplicada a las ciencias biomoleculares. Científicos dedicados a la biología de los ámbitos académico y comercial cooperaron en el marco de Embrace con el fin de integrar, optimizar y compartir herramientas y recursos informáticos de sus respectivos campos. Estos grupos y recursos europeos, antes desvinculados entre sí, dieron lugar a una intensa cooperación tendente a recoger, mantener y organizar un amplio espectro de información biomolecular. Con el fin de integrar esta información heterogénea se aplicó toda una variedad de herramientas y bases de datos facilitados por el Instituto Europeo de Bioinformática (EBI). Se creó y validó una interfaz común con estándares definidos para la presentación e integración de la información, diversa y anteriormente dispersa. Todo el público europeo puede ya acceder a esta plataforma de difusión de información. Los científicos de Embrace se mantuvieron al tanto y explotaron los avances en informática y desarrollaron novedosas herramientas e interfaces de programación para el campo de la bioinformática. Asimismo, grupos interesados en este campo, tanto de dentro como de fuera de Embrace, tuvieron ocasión de acudir a cursos de formación sobre el desarrollo y la aplicación de diversas herramientas pertinentes. Así, por medio del proyecto se estableció una infraestructura básica para la integración común y exhaustiva de datos y recursos de biología. La nueva ontología EDAM (Embrace Data and Methods), empleada como estándar de anotación, se encuentra también disponible al público en el Laboratorio Europeo de Biología Molecular del EBI (EMBL-EBI).
