Des plateformes de production de protéines en Europe
Le projet PCUBE(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) («Infrastructure for protein production platforms»), financé par l'UE, a tenté de développer, d'améliorer et de normaliser la production de protéines et les technologies de dépistage et de cristallisation. Les membres de PCUBE ont rencontré un franc succès dans leurs efforts. Pour réaliser la production à haut débit, ils ont développé des protocoles en faveur de l'automatisation. Ils ont optimisé et ont normalisé les méthodes de biologie moléculaire pour la sélection de protéines et la caractérisation ainsi que la purification de l'ADN pour améliorer la qualité des protéines. Parmi les autres domaines d'intérêt figurent l'optimisation des techniques de microscopie optique et l'établissement de systèmes d'expression protéique efficaces dans les cellules des procaryotes, des insectes et des mammifères. L'ATN a été accordé aux projets de 384 scientifiques originaires de 30 différents pays de l'Europe. En parallèle, une dizaine de stages de formation ont été offerts sur la production de protéines et sur les méthodes d'expression, de caractérisation et de cristallisation ainsi que sur les technologies d'ingénierie de protéines. La production de protéines de bonne qualité en grandes quantités est désormais possible grâce à des systèmes comme MultiBac qui utilise un baculovirus pour reprogrammer des cultures cellulaires d'insectes et est inoffensif pour l'homme. Ils l'ont optimisé pour une production en masse de complexes à plusieurs protéines. De nombreux chercheurs européens ont accédé à cette technologie brevetée via l'ATN de PCUBE pour produire des protéines d'intérêt. Par exemple, SweetBac a été conçu et a un potentiel inexploité en ce qui concerne la production d'anticorps. Le financement de PCUBE a permis de réaliser l'automatisation d'une méthode de dépistage de complexes de protéines qui a entraîné le développement de la technologie CoESPRIT. Cette dernière a été employée par les utilisateurs ATN pour optimiser davantage le clonage à haut débit. L'automatisation pour la sélection et la production efficace de protéines répétées d'ankyrine (DARPin) a également été financée par PCUBE. Plusieurs agents de liaison ont été développés pour des cibles protéiques spécifiques en utilisant la technologie DARPin et ont été distribués aux utilisateurs de l'ATN pour leurs travaux de recherche. Le projet a permis le suivi in vivo de cellules vivantes et les interactions continues entre protéines grâce à des techniques comme la spectroscopie de corrélation par fluorescence et la microscopie de positionnement spectrale. Des technologies à haut débit abordables pour la cristallisation de protéines et la diffraction de rayons X in situ fiables et précises ont été développées. PCUBE a réussi à développer l'innovation technologique en établissant des références en biologie structurelle et dans l'ATN pour des installations et des instruments de haute précision par le biais d'activités de recherche conjointes. En plus de la recherche fondamentale, les applications des technologies de PCUBE toucheront la sécurité alimentaire, la protection de l'environnement, la biomédecine, l'énergie écologique et la biodétection.
