Europejska platforma do produkcji białek
Finansowany przez UE projekt "Infrastructure for protein production platforms" (PCUBE)(odnośnik otworzy się w nowym oknie) obejmował prace nad stworzeniem, udoskonaleniem i standaryzacją technologii produkcji, badań przesiewowych i krystalizacji białek. Uczestnicy projektu PCUBE osiągnęli pełen sukces. Do celów produkcji wysokoprzepustowej opracowano protokoły sprzyjające robotyzacji i automatyzacji. Zoptymalizowano i ustandaryzowano metody biologii molekularnej do selekcji i charakterystyki 3D białek, jako również oczyszczania DNA do uzyskiwania białek lepszej jakości. Do innych obszarów prac należało zoptymalizowanie technik mikroskopii świetlnej i opracowanie wydajnych systemów ekspresji białek w komórkach prokariotycznych: owadzich i ssaczych. Dostęp do platformy TNA przyznano 384 naukowcom i ich projektom z 30 różnych krajów Europejskich. Jednocześnie zaproponowano 10 warsztatów szkoleniowych dotyczących produkcji, oczyszczania, ekspresji, charakteryzowania i krystalizacji białek, jak również technik inżynieryjnych ich tworzenia. Produkcja białek w dużych ilościach i o wysokiej jakości jest teraz możliwa dzięki takim systemom jak MultiBac, który wykorzystuje bakulowirusa do przeprogramowania komórek owadzich i jest nieszkodliwy dla ludzi. Udało się zoptymalizować tę metodę i wytwarzać z jej użyciem duże ilości określonych kompleksów wielu białek. Wielu naukowców europejskich skorzystało z dostępu do tej opatentowanej technologii poprzez platformę TNA projektu PCUBE, aby wytwarzać określone białka. Stworzono na przykład metodami inżynieryjnymi białko SweetBac o ogromnym potencjale pod względem wytwarzania przeciwciał. Finansowanie projektu PCUBE pomogło zautomatyzować metodę prowadzenia badań przesiewowych kompleksów białkowych, przyczyniając się do powstania technologii CoESPRIT. Zostało to wykorzystane przez użytkowników platformy TNA do dalszej optymalizacji wysokoprzepustowego klonowania. W projekcie PCUBE opracowano też automatyzację umożliwiającą wydajną selekcję i produkcję pożądanych białek zbudowanych z powtórzeń ankirynowych (DARPins). Opracowano szereg substancji wiążących swoiste białkowe cele molekularne w technologii DARPin i przekazano wyniki użytkownikom platformy TNA do dalszych badań. Projekt umożliwił też monitorowanie in vivo komórek i utrzymujących się oddziaływań między białkami poprzez takie techniki, jak spektroskopia krzyżowej korelacji fluorescencji i mikroskopowe określanie pozycji spektralnej. Opracowano tanie, niezawodne i dokładne wysokoprzepustowe technologie do krystalizacji białek i dyfrakcji rentgenowskiej in situ. Projekt PCUBE z powodzeniem wprowadził innowacje technologiczne ustalając wzorce dla biologii strukturalnej i platform TNA w tworzeniu urządzeń o dużej precyzji w ramach zespołowych działań badawczych. Oprócz badań podstawowych technologie projektu PCUBE znajdą zastosowanie w bezpieczeństwie żywności, ochronie środowiska, biomedycynie, odnawialnych źródłach energii i biosensorach.
