Une source aquatique pour de nouveaux antibiotiques
Les antibiotiques sont des molécules biologiquement actives isolées à partir de champignons, de bactéries ou de plantes qui ont révolutionné la médecine en permettant l'éradication des infections bactériennes. Malheureusement, l'apparition de pathogènes résistants aux antibiotiques fait peser à nouveau une réelle menace sur la santé humaine et rend nécessaire la découverte et le développement de nouvelles molécules. Les métabolites secondaires naturels sont depuis longtemps utilisés comme modèles de structures chimiques pour le développement de nouveaux composés thérapeutiques. Le projet COGNISEPLANCTOMYCES («Construction of a genetic system for Planctomycetes»), financé par l'UE, a donc décidé d'explorer le potentiel du phylum récemment découvert des planctomycètes. Les planctomycètes sont des bactéries à croissance lente qui dominent les biofilms; par conséquent, la génération d'antibiotiques spécifiques permettent d'évincer les compétiteurs hétérotrophes à croissance rapide. Le séquençage du génome des planctomycètes et son analyse bio-informatique a déjà permis aux chercheurs de montrer que ces bactéries produisaient des métabolites secondaires d'un type nouveau. Il fallait par contre trouver un organisme modèle génétiquement transformable pour pouvoir analyser leur production potentielle de nouvelles molécules antibiotiques. Les chercheurs ont pour ce faire, développé des outils moléculaires pour la transformation d'un membre du phylum, Planctomyces limnophillus. Plus de détails sur le projet sont accessibles en ligne sur le site. Parallèlement au développement de ce système génétique, les scientifiques ont également étudié par exploration du génome, la possibilité de synthétiser de petites molécules dans ces organismes. D'autres expériences de biologie moléculaire et d'analyse des gènes et opérons associés à ces métabolites secondaires sont encore nécessaires avant de pouvoir déterminer et caractériser entièrement la structure chimique de ces nouvelles molécules. La transformation génétique des planctomycètes pourrait se révéler utile, non seulement pour la production de nouveaux antibiotiques mais aussi pour des applications biotechnologiques comme le traitement des eaux usées.
