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Opening doors to excellence. Enabling OMICs high-thROughput techNologies at the Faculty of Medicine Jagiellonian University Medical College

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Une nouvelle impulsion dans la recherche «omique» pour le Collegium Medicum de l'université Jagellonne de Cracovie

L'université Jagellonne de Cracovie est la deuxième plus ancienne université d'Europe centrale, elle constitue un centre majeur de recherche scientifique. Une initiative financée par l'UE a permis d'améliorer les capacités de recherche du Collegium Medicum de l'université Jagellonne de Cracovie en Pologne.

Les objectifs principaux du projet triennal OMICRON(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) (Opening doors to excellence: enabling OMICs high-throughput technologies at the Faculty of Medicine Jagiellonian University Medical College) consistaient surtout en une remise à niveau des infrastructures existantes ainsi qu'à la formation et au développement des chercheurs et futurs responsables. Les universités de la République tchèque, d'Allemagne, de Grèce, d'Islande, de Norvège et du Royaume-Uni ont coopéré avec le Collegium Medicum de l'Université Jagellone (JUMC) dans le cadre de ce projet. Pendant la première phase du projet, un centre «omique» moderne, le laboratoire Omicron, a été mis en place avec tout l'équipement de pointe nécessaire pour une recherche moderne en génomique, transcriptomique et en recherche et analyse protéomique. Les techniciens et post-docs ont ainsi pu suivre une formation adéquate. Pendant la deuxième phase du projet, les actions menées se sont concrétisées par l'embauche de 10 chercheurs post-doctorants, la plupart de nationalité polonaise, qui ont ainsi apporté au centre, une expertise obtenue dans plusieurs institutions internationales de recherche aux États-Unis et l'Union européenne. Sept employés qualifiés de soutien technique ont également été recrutés pour l'assistance technologique et informatique de cet équipement. Un programme de professeurs invités a permis d'accueillir trente chercheurs étrangers afin qu'ils présentent leurs travaux dans tous les domaines d'intérêt pour OMICRON. Les chercheurs du JUMC et les étudiants en doctorat ont participé à de nombreuses conférences et formations dans plusieurs institutions de recherche européennes dans le cadre d'un programme d'échanges des connaissances. Ces formations traitaient par exemple de la manipulation d'un grand nombre d'échantillons, de l'utilisation des technologies de haut débit ou de l'analyse de quantités importantes de données. En tant qu'Action de coordination et de soutien (ACS) dans le cadre du programme de financement FP7-REGPOT, OMICRON n'a pas vocation à produire des résultats scientifiques ou technologiques. Sa création a cependant ouvert de nombreuses opportunités scientifiques et universitaires pour toute l'équipe du Collegium Medicum. Il a par ailleurs largement contribué à l'emploi et donc au retour au pays de scientifiques polonais. Plusieurs médias de diffusion ont également été développés et produits afin d'améliorer la visibilité d'OMICRON et celle de la faculté de médecine de Jagellonne. La diffusion de ces résultats s'est faite grâce au site internet du projet, aux média locaux, nationaux et internationaux ainsi que par les nombreuses conférences, les ateliers de travail et les évènements européens de réseautage. Les actions du projet ont également favorisé l'émergence de nouvelles collaborations entre les chercheurs du JUMC et les principales institutions de recherche européennes. Au final, les travaux d'OMICRON ont d'ores et déjà eu un impact sur la communauté scientifique locale et placé le Centre OMICRON et le JUMC comme des partenaires recherchés pour des collaborations scientifiques. Le renforcement de la visibilité du centre et les nouvelles opportunités de collaboration de recherche devraient également profiter au développement économique et social de cette région historique de Pologne qu'est la Petite-Pologne (Malopolska).

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