Descripción del proyecto
Estudio de la evolución de los virus
Los virus son parásitos ubicuos relacionados con la evolución humana y están ampliamente estudiados. Con todo, aún no se conoce muy bien su evolución a largo plazo. ya que carecen de un registro fósil geológico. El descubrimiento de los elementos víricos endógenos, que son restos de virus integrados de forma heredable en el genoma de sus hospedadores, ha favorecido el desarrollo de la nueva disciplina de la paleovirología. En el proyecto PALVIREVOL, financiado con fondos europeos, se desarrollarán metodologías innovadoras para estudiar este registro fósil genómico. Para ello, se evaluará cómo difiere la dinámica de transmisión vírica entre organismos y a lo largo del tiempo, así como los factores que influyen en el flujo de genes entre virus y hospedador. El objetivo es dilucidar las características moleculares que afectan la inmunidad del huésped y la patogenicidad vírica.
Objetivo
Viruses are ubiquitous, obligate intracellular parasites that have had a pervasive influence on the evolutionary history of life. Despite being extensively studied due to their role in disease, very little is known about their long-term evolution, since they do not form a geological fossil record. The new field of paleovirology is the study of ancient viruses, which in the genomic age has been facilitated by discoveries of endogenous viral elements (EVEs). EVEs are the remnants of viruses that have heritably integrated into the genomes of their hosts and we were the first to discover that viruses of all genome types can endogenise. This genomic fossil record contains information about viral/host interactions that would be impossible to recover from contemporary viral sequences. We will develop novel methodologies to exploit this data source in order to quantify how viral transmission dynamics vary between organisms and over time, and to identify the factors that determine this. While most EVEs are non-functional relics, they are sometimes captured and repurposed by their hosts to serve a beneficial function as antiviral genes. These remarkable examples indicate an important role for virus to host gene flow in evolution, and we will determine the nature and extent of this phenomenon. This gene exchange is mirrored in viruses that capture host genes to evade immune responses. We will integrate bioinformatics, evolutionary, and experimental techniques, to elucidate the evolutionary processes underlying virus-host gene flow in both directions, and to determine the molecular features that impact host immunity and viral pathogenicity. Now is the time to pursue this research, given the unprecedented availability of genomic data and the emergence of paleovirology. Our results will greatly improve our understanding of viral cross-species transmission, as well as the role of gene flow on the evolutionary arms race between viruses and their hosts over geological timescales.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.
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Palabras clave
Programa(s)
Régimen de financiación
ERC-COG - Consolidator GrantInstitución de acogida
OX1 2JD Oxford
Reino Unido