Paleovirology, the evolutionary dynamics of viral cross-species transmissions, and the consequences of virus-host gene exchange

Información del proyecto

PALVIREVOL

Identificador del acuerdo de subvención: 101001623

DOI

10.3030/101001623

Fecha de la firma de la CE 30 Marzo 2021

Fecha de inicio 1 Octubre 2021

Fecha de finalización 31 Marzo 2028

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 1 999 805,00

Aportación de la UE

€ 1 999 805,00

Coordinado por

THE CHANCELLOR, MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF OXFORD
United Kingdom

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Publicaciones

Peer reviewed articles (10)

Ecological and evolutionary dynamics of cell-virus-virophage systems

Autores: Jose Gabriel Nino Barreat, Aris Katzourakis
Publicado en: PLoS Computational Biology, 2024, ISSN 1553-734X
Editor: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pcbi.1010925

Four principles to establish a universal virus taxonomy

Autores: Peter Simmonds, Evelien M. Adriaenssens, F. Murilo Zerbini, Nicola G. A. Abrescia, Pakorn Aiewsakun, Poliane Alfenas-Zerbini, Yiming Bao, Jakub Barylski, Christian Drosten, Siobain Duffy, W. Paul Duprex, Bas E. Dutilh, Santiago F. Elena, Maria Laura García, Sandra Junglen, Aris Katzourakis, Eugene V. Koonin, Mart Krupovic, Jens H. Kuhn, Amy J. Lambert, Elliot J. Lefkowitz, Małgorzata Łobocka, C
Publicado en: PLoS Biology, Edición 21(2), 2023, Página(s) e3001922, ISSN 1544-9173
Editor: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pbio.3001922

Investigating the evolutionary origins of the first three SARS-CoV-2 variants of concern

Autores: Mahan Ghafari, Qihan Liu, Arushi Dhillon, Aris Katzourakis, Daniel B. Weissman
Publicado en: Frontiers in virology, 2022, ISSN 2673-818X
Editor: Fronteirs Media
DOI: 10.3389/fviro.2022.942555

Evolutionary Analysis of Placental Orthologues Reveals Two Ancient DNA Virus Integrations

Autores: Jose Gabriel Nino Barreat, Aris Katzourakis
Publicado en: Journal of Virology, 2022, ISSN 1098-5514
Editor: American Society of Microbiology
DOI: 10.1128/jvi.00933-22

Revisiting the origins of the Sobemovirus genus: A case for ancient origins of plant viruses

Autores: Mahan Ghafari , Merike Sõmera, Cecilia Sarmiento, Annette Niehl, Eugénie Hébrard, Theocharis Tsoleridis, Jonathan Ball, Benoît Moury, Philippe Lemey, Aris Katzourakis, Denis Fargette
Publicado en: PLoS Pathogens, 2023, ISSN 1553-7366
Editor: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.ppat.1011911

Discovery of novel papillomaviruses in the critically endangered Malayan and Chinese pangolins

Autores: Jose Gabriel Nino Barreat, Anselmo Jiro Kamada, Charles Reuben de Souza, Aris Katzourakis
Publicado en: Biology Letters, Edición 19, 2023, Página(s) 20220464, ISSN 1744-957X
Editor: Royal Society
DOI: 10.1098/rsbl.2022.0464

Purifying selection determines the short-term time dependency of evolutionary rates in SARS-CoV-2 and pH1N1 influenza

Autores: Mahan Ghafari, Louis du Plessis, Jayna Raghwani, Samir Bhatt, Bo Xu, Oliver G Pybus, Aris Katzourakis
Publicado en: Molecular Biology and Evolution, Edición Edición 2, 2023, Página(s) msac009, ISSN 1537-1719
Editor: Oxford University Press on behalf of the Society for Molecular Biology and Evolution
DOI: 10.1093/molbev/msac009

The evolution of SARS-CoV-2

Autores: Peter V. Markov, Mahan Ghafari, Martin Beer, Katrina Lythgoe, Peter Simmonds, Nikolaos I. Stilianakis & Aris Katzourakis
Publicado en: Nature Reviews Microbiology, 2023, ISSN 1740-1526
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41579-023-00878-2

Deep mining reveals the diversity of endogenous viral elements in vertebrate genomes

Autores: Jose Gabriel Nino Barreat, Aris Katzourakis
Publicado en: Nature Microbiology, Edición 9, 2024, Página(s) 3013–3024, ISSN 2058-5276
Editor: Nature Portfolio
DOI: 10.1038/s41564-024-01825-4

A framework for reconstructing SARS-CoV-2 transmission dynamics using excess mortality data

Autores: Mahan Ghafari, Oliver J. Watson, Ariel Karlinsky, Luca Ferretti, Aris Katzourakis
Publicado en: Nature Communications, Edición 13, 2022, Página(s) Article Number: 3015, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-30711-y

Other (1)

Deep-mining of vertebrate genomes reveals an unexpected diversity of endogenous viral elements

Autores: Jose Gabriel Nino Barreat, Aris Katzourakis
Publicado en: bioRxiv, 2023
Editor: biorxiv
DOI: 10.1101/2023.10.26.564176