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Quantitative Investigation of Interspecies Differences in Developmental Tempo

Description du projet

Une question de synchronisation: le paradigme du développement embryonnaire

Le développement embryonnaire commence après la fertilisation et implique les mêmes étapes dans de nombreuses espèces, bien qu’à des rythmes différents en fonction de l’organisme. L’étiologie sous-jacente des différences dans la chronologie développementale entre espèces reste peu comprise. Selon l’hypothèse de travail du projet ALLOCHRONY, financé par l’UE, l’allochronie développementale est causée par différents rythmes dans les principales réactions biochimiques. Les chercheurs développeront des organoïdes à partir de cellules souches pluripotentes qui reproduisent les premières étapes de l’embryogenèse pour étudier des réactions clés dans des cellules humaines et murines. Les résultats permettront d’améliorer les connaissances actuelles sur le développement embryonnaire et d’identifier les étapes limitant les rythmes du processus.

Objectif

While the mechanisms of embryonic development are well conserved, the progression speed differs among animal species. The molecular cause of ‘allochrony’, interspecies differences in developmental tempo, remains unclear due to lack of an appropriate experimental model. In vitro differentiation of pluripotent stem cells (PSCs) offers unique opportunities to compare the same cell type among diverse species in a similar condition.
We have previously recapitulated the oscillatory gene expression of the segmentation clock with PSCs, demonstrating ~2 hour and ~5 hour oscillation periods in murine and human induced presomitic mesoderm (PSM) cells, respectively. We have further found that the period difference stems from differential biochemical reaction speeds of HES7, a core segmentation clock gene, between the species: human PSM cells show slower degradation rates of HES7 and longer delays in its production processes than mouse cells.
Here we aim to investigate the deeper origin of developmental allochrony, the molecular mechanism by which human cells exhibit slower biochemical reactions. We will systematically and quantitatively measure the degradation rates and delays to reveal commonalities of the genes that show differential reaction speeds between murine and human cells (Aim 1). In parallel, we will test two working hypotheses that nuclear/cytoplasmic transport rates or metabolic rates might be lower in human cells, which should lead to slower biochemical reactions (Aim 2).
The other objective is to test the universality of the mechanism of allochrony. We will create gastruloids, organoids mimicking early embryogenesis, from PSCs of diverse mammalian species to investigate what cell types, in addition to PSM cells, and what species exhibit the differential biochemical reaction speeds (Aim 3).
This study will tackle a fundamental question in biology by using quantitative, cutting-edge technologies, ultimately enabling manipulation of developmental time.

Régime de financement

ERC-COG - Consolidator Grant

Institution d’accueil

TECHNISCHE UNIVERSITAET DRESDEN
Contribution nette de l'UE
€ 1 043 400,00
Adresse
HELMHOLTZSTRASSE 10
01069 Dresden
Allemagne

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Région
Sachsen Dresden Dresden, Kreisfreie Stadt
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total
€ 1 043 400,00

Bénéficiaires (2)