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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Learning from the past: linking ancestral epigenetic states to current cellular fates with single-cell multi-omic approaches

Descripción del proyecto

Dilucidación de los mecanismos de la determinación del destino celular

El objetivo del proyecto financiado con fondos europeos FateID es desvelar los mecanismos que subyacen a la especificación del destino celular y los estados epigenéticos precedentes. Los investigadores del proyecto tratarán de desarrollar una nueva estrategia para la elaboración simultánea de los perfiles de los numerosos factores que intervienen en la regulación génica en una misma célula. Su aplicación proporcionará información sobre los controles transcripcionales, revelará las relaciones causales entre las modificaciones de las histonas, su disposición espacial en el núcleo y las proteínas del grupo Polycomb. Posteriormente, los investigadores aplicarán una estrategia de «memoria molecular» para obtener registros de estados reguladores pasados, a la que seguirá la aplicación de métodos de análisis unicelulares a fin de desvelar los mecanismos de regulación génica que rigen la determinación del linaje en el desarrollo temprano de los ratones.

Objetivo

The establishment of cell type-specific transcriptional programs involves many interconnected regulatory mechanisms acting on different genomic scales. To dissect this multi-layered control of gene expression in detail, I will develop methods that a) measure multiple cellular outputs in single cells, and b) obtain that information in a time-resolved manner. This proposal outlines my approach to study early mouse development at numerous levels, including (but not limited to) transcription, chromatin context, and nuclear organization. In doing so, I expect to shed light on the mechanism behind cell fate specification and the epigenetic states that precede it.

I will develop a novel strategy to simultaneously profile many factors involved in gene regulation in the same cell. Its successful implementation will give insight into transcriptional control at unprecedented modality, revealing the causal relationships between histone modifications, spatial positioning within the nucleus, Polycomb group proteins, and others. Next, I will pursue several “molecular memory” strategies to obtain recordings of past regulatory states, followed by multi-omic readouts at later developmental times. Such retrospective analyses enable linking fate decisions to past molecular events in the same cell, thereby permitting careful reconstruction of the molecular trajectories underlying cell fate choice. Finally, these and previously developed single-cell methods will be applied to unravel the gene-regulatory mechanisms that govern lineage determination in early mouse development.

Palabras clave

Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).

Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

ERC-COG - Consolidator Grant

Ver todos los proyectos financiados en el marco de este régimen de financiación

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2020-COG

Ver todos los proyectos financiados en el marco de esta convocatoria

Institución de acogida

KONINKLIJKE NEDERLANDSE AKADEMIE VAN WETENSCHAPPEN - KNAW
Aportación neta de la UEn

Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.

€ 2 000 000,00
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

€ 2 000 000,00

Beneficiarios (1)

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