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Learning from the past: linking ancestral epigenetic states to current cellular fates with single-cell multi-omic approaches

Projektbeschreibung

Entschlüsselung der Mechanismen zur Bestimmung des Zellschicksals

Ziel des EU-finanzierten Projekts FateID ist es, die Mechanismen hinter der Bestimmung des Zellschicksals und den vorangehenden epigenetischen Zuständen aufzudecken. Zu diesem Zweck wollen die Forschenden eine neuartige Strategie für die parallele Analyse der vielen an der Genregulation beteiligten Faktoren in einer einzigen Zelle entwickeln. Die Umsetzung dieser Strategie wird Einblicke in die Kontrollmechanismen der Transkription ermöglichen und die kausalen Beziehungen zwischen Histonmodifikationen, deren räumlicher Positionierung innerhalb des Zellkerns sowie der Proteine der Polycomb-Gruppe aufdecken. In einem nächsten Schritt wird die Forschungsgruppe versuchen, eine Strategie des „molekularen Gedächtnisses“ anzuwenden, um Aufzeichnungen vergangener Regulationszustände zu erhalten, gefolgt von Methoden der Einzelzellanalyse, um die Mechanismen der Genregulation zu entschlüsseln, welche die Abstammungsfindung in der frühen Entwicklung von Mäusen bestimmen.

Ziel

The establishment of cell type-specific transcriptional programs involves many interconnected regulatory mechanisms acting on different genomic scales. To dissect this multi-layered control of gene expression in detail, I will develop methods that a) measure multiple cellular outputs in single cells, and b) obtain that information in a time-resolved manner. This proposal outlines my approach to study early mouse development at numerous levels, including (but not limited to) transcription, chromatin context, and nuclear organization. In doing so, I expect to shed light on the mechanism behind cell fate specification and the epigenetic states that precede it.

I will develop a novel strategy to simultaneously profile many factors involved in gene regulation in the same cell. Its successful implementation will give insight into transcriptional control at unprecedented modality, revealing the causal relationships between histone modifications, spatial positioning within the nucleus, Polycomb group proteins, and others. Next, I will pursue several “molecular memory” strategies to obtain recordings of past regulatory states, followed by multi-omic readouts at later developmental times. Such retrospective analyses enable linking fate decisions to past molecular events in the same cell, thereby permitting careful reconstruction of the molecular trajectories underlying cell fate choice. Finally, these and previously developed single-cell methods will be applied to unravel the gene-regulatory mechanisms that govern lineage determination in early mouse development.

Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

ERC-COG - Consolidator Grant

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) ERC-2020-COG

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Gastgebende Einrichtung

KONINKLIJKE NEDERLANDSE AKADEMIE VAN WETENSCHAPPEN - KNAW
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 2 000 000,00
Adresse
KLOVENIERSBURGWAL 29 HET TRIPPENHUIS
1011 JV AMSTERDAM
Niederlande

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Aktivitätstyp
Research Organisations
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

€ 2 000 000,00

Begünstigte (1)

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