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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Learning from the past: linking ancestral epigenetic states to current cellular fates with single-cell multi-omic approaches

Description du projet

Découvrir les mécanismes de la détermination du destin cellulaire

L’objectif du projet FateID, financé par l’UE, est de découvrir les mécanismes qui déterminent le destin des cellules et les états épigénétiques qui les précèdent. Les chercheurs visent à développer une nouvelle stratégie pour le profilage simultané des nombreux facteurs impliqués dans la régulation des gènes dans une cellule unique. Sa mise en œuvre permettra de mieux comprendre les contrôles transcriptionnels, en révélant les relations causales entre les modifications des histones, leur positionnement spatial dans le noyau et les protéines du groupe Polycomb. Ensuite, les chercheurs essaieront d’appliquer une stratégie de «mémoire moléculaire» pour obtenir des enregistrements d’états de régulation antérieurs, puis des méthodes d’analyse unicellulaire pour démêler les mécanismes de régulation des gènes qui régissent la détermination de la lignée lors du développement précoce chez la souris.

Objectif

The establishment of cell type-specific transcriptional programs involves many interconnected regulatory mechanisms acting on different genomic scales. To dissect this multi-layered control of gene expression in detail, I will develop methods that a) measure multiple cellular outputs in single cells, and b) obtain that information in a time-resolved manner. This proposal outlines my approach to study early mouse development at numerous levels, including (but not limited to) transcription, chromatin context, and nuclear organization. In doing so, I expect to shed light on the mechanism behind cell fate specification and the epigenetic states that precede it.

I will develop a novel strategy to simultaneously profile many factors involved in gene regulation in the same cell. Its successful implementation will give insight into transcriptional control at unprecedented modality, revealing the causal relationships between histone modifications, spatial positioning within the nucleus, Polycomb group proteins, and others. Next, I will pursue several “molecular memory” strategies to obtain recordings of past regulatory states, followed by multi-omic readouts at later developmental times. Such retrospective analyses enable linking fate decisions to past molecular events in the same cell, thereby permitting careful reconstruction of the molecular trajectories underlying cell fate choice. Finally, these and previously developed single-cell methods will be applied to unravel the gene-regulatory mechanisms that govern lineage determination in early mouse development.

Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

ERC-COG - Consolidator Grant

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2020-COG

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Institution d’accueil

KONINKLIJKE NEDERLANDSE AKADEMIE VAN WETENSCHAPPEN - KNAW
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 2 000 000,00
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

€ 2 000 000,00

Bénéficiaires (1)

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