Cyclic Peptide Platform as an Approach to Target Validation

Información del proyecto

CPTarget

Identificador del acuerdo de subvención: 101003111

DOI

10.3030/101003111

Fecha de la firma de la CE 27 Enero 2021

Fecha de inicio 1 Octubre 2021

Fecha de finalización 31 Marzo 2028

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 2 241 271,00

Aportación de la UE

€ 2 241 271,00

Coordinado por

UNIVERSITY OF NEWCASTLE UPON TYNE
United Kingdom

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Publicaciones

Peer reviewed articles (11)

Cyclic peptides target the aromatic cage of a PHD-finger reader domain to modulate epigenetic protein function

Autores: Oliver D. Coleman, Jessica Macdonald, Ben Thomson, Jennifer A. Ward, Christopher J. Stubbs, Tom E. McAllister, Shane Clark, Siddique Amin, Yimang Cao, Martine I. Abboud, Yijia Zhang, Hitesh Sanganee, Kilian V. M. Huber, Tim D. W. Claridge, Akane Kawamura
Publicado en: Chemical Science, 2023, Página(s) 7136-7146, ISSN 2041-6520
Editor: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2sc05944d

Macrocyclic Peptide Probes for Immunomodulatory Protein CD59: Potent Modulators of Bacterial Toxin Activity and Antibody‐Dependent Cytotoxicity

Autores: Jasmine K. Bickel, Ammar. I. S. Ahmed, Aidan B. Pidd, Rhodri M. Morgan, Tom E. McAllister, Sam Horrell, Emma C. Couves, Hemavathi Nagaraj, Edward J. Bartlett, Kamel El Omari, Akane Kawamura, Doryen Bubeck, Edward W. Tate
Publicado en: Angewandte Chemie, Edición 137, 2026, ISSN 0044-8249
Editor: Wiley
DOI: 10.1002/ange.202422673

Selective targeting of human TET1 by cyclic peptide inhibitors: Insights from biochemical profiling

Autores: Klemensas Šimelis; Hilal Saraç; Eidarus Salah; Kosuke Nishio; Tom E. McAllister; Thomas P. Corner; Anthony Tumber; Roman Belle; Christopher J. Schofield; Hiroaki Suga; Akane Kawamura
Publicado en: Bioorganic & Medicinal Chemistry, Edición Volume 99, 2024, ISSN 0968-0896
Editor: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.bmc.2024.117597

Unravelling 2-oxoglutarate turnover and substrate oxidation dynamics in 5-methylcytosine-oxidising TET enzymes

Autores: Klemensas Šimelis, Roman Belle, Akane Kawamura
Publicado en: Communications Chemistry, Edición 7, 2024, ISSN 2399-3669
Editor: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s42004-024-01382-1

KDM3A catalyses the oxidation of acetyl-lysine to hydroxyacetyl-lysine on histone H3K9

Autores: Roman Belle, John-Paul Bukowski, Rachel Schiller, Ronald Cutler, Eidarus Salah, Robert S. Dawber, Anthony Tumber, Joanna Bonnici, Jessica D. Kindrick, Loane Serrano, Patrick Rabe, Catrine Johansson, Marie-Hélène Ruchaud, Richard J. Hopkinson, William D. Figg, Sr, Paul E. Brennan, David R. Mole, Simone Sidoli, Akane Kawamura, Christopher J. Schofield
Publicado en: Nature Chemistry, Edición 18, 2026, Página(s) 823-834, ISSN 1755-4330
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41557-026-02112-x

Cyclic β2,3-amino acids improve the serum stability of macrocyclic peptide inhibitors targeting the SARS-CoV-2 main protease

Autores: Takashi Miura, Tika R Malla, Lennart Brewitz, Anthony Tumber, Eidarus Salah, Kang Ju Lee, Naohiro Terasaka, C David Owen, Claire Strain-Damerell, Petra Lukacik, Martin A Walsh, Akane Kawamura, Christopher J Schofield, Takayuki Katoh, Hiroaki Suga
Publicado en: Bulletin of the Chemical Society of Japan, Edición 97, 2024, ISSN 0009-2673
Editor: Chemical Society of Japan/Nippon Kagakukai
DOI: 10.1093/bulcsj/uoae018

The influence of degree of labelling upon cellular internalisation of antibody-cell penetrating peptide conjugates.

Autores: Toni A. Pringle; Oliver Coleman; Akane Kawamura; James C. Knight
Publicado en: RSC Advances, 2022, ISSN 1473-7604
Editor: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2ra05274a

Focused Screening Identifies Different Sensitivities of Human TET Oxygenases to the Oncometabolite 2-Hydroxyglutarate

Autores: Roman Belle; Hilal Saraç; Eidarus Salah; Bhaskar Bhushan; Aleksandra Szykowska; Grace Roper; Anthony Tumber; Skirmantas Kriaucionis; Nicola Burgess-Brown; Christopher J. Schofield; Tom Brown; Akane Kawamura
Publicado en: Journal of Medicinal Chemistry, Edición 67 (6), 2024, Página(s) 4525-4540, ISSN 0022-2623
Editor: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jmedchem.3c01820

In vitro selection of macrocyclic peptide inhibitors containing cyclic γ2,4-amino acids targeting the SARS-CoV-2 main protease

Autores: Takashi Miura; Tika R. Malla; C. David Owen; Anthony Tumber; Lennart Brewitz; Michael A. McDonough; Eidarus Salah; Naohiro Terasaka; Takayuki Katoh; Petra Lukacik; Claire Strain-Damerell; Halina Mikolajek; Martin A. Walsh, Akane Kawamura; Christopher J. Schofield; Hiroaki Suga;
Publicado en: Nature Chemistry, 2023, ISSN 1755-4330
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41557-023-01205-1

Identification and engineering of potent cyclic peptides with selective or promiscuous binding through biochemical profiling and bioinformatic data analysis

Autores: Thomas P. Smith; Bhaskar Bhushan; Daniele Granata; Christian S. Kaas; Birgitte Andersen; Klaas W. Decoene; Qiansheng Ren; Haimo Liu; Xinping Qu; Yang Yang; Jia Pan; Quijia Chen; Martin Münzel; Akane Kawamura
Publicado en: RSC Chemical Biology, Edición Volume 5, Edición 1, 2024, Página(s) 1-64, ISSN 2633-0679
Editor: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d3cb00168g

Fragment expansion with NUDELs - poised DNA-encoded libraries

Autores: Catherine LA Salvini, Benoit Darlot, Jack Davison, Mathew Martin, Susan Tudhope, Shannon Turberville, Akane Kawamura, Martin EM Noble, Stephen Wedge, James John Crawford, Michael James Waring,
Publicado en: Chemical Science, 2023, ISSN 2041-6520
Editor: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d3sc01171b