Cyclic Peptide Platform as an Approach to Target Validation

Informations projet

CPTarget

N° de convention de subvention: 101003111

DOI

10.3030/101003111

Date de signature de la CE 27 Janvier 2021

Date de début 1 Octobre 2021

Date de fin 31 Mars 2028

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 2 241 271,00

Contribution de l’UE

€ 2 241 271,00

Coordonné par

UNIVERSITY OF NEWCASTLE UPON TYNE
United Kingdom

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Publications

Peer reviewed articles (11)

Cyclic peptides target the aromatic cage of a PHD-finger reader domain to modulate epigenetic protein function

Auteurs: Oliver D. Coleman, Jessica Macdonald, Ben Thomson, Jennifer A. Ward, Christopher J. Stubbs, Tom E. McAllister, Shane Clark, Siddique Amin, Yimang Cao, Martine I. Abboud, Yijia Zhang, Hitesh Sanganee, Kilian V. M. Huber, Tim D. W. Claridge, Akane Kawamura
Publié dans: Chemical Science, 2023, Page(s) 7136-7146, ISSN 2041-6520
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2sc05944d

Macrocyclic Peptide Probes for Immunomodulatory Protein CD59: Potent Modulators of Bacterial Toxin Activity and Antibody‐Dependent Cytotoxicity

Auteurs: Jasmine K. Bickel, Ammar. I. S. Ahmed, Aidan B. Pidd, Rhodri M. Morgan, Tom E. McAllister, Sam Horrell, Emma C. Couves, Hemavathi Nagaraj, Edward J. Bartlett, Kamel El Omari, Akane Kawamura, Doryen Bubeck, Edward W. Tate
Publié dans: Angewandte Chemie, Numéro 137, 2026, ISSN 0044-8249
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1002/ange.202422673

Selective targeting of human TET1 by cyclic peptide inhibitors: Insights from biochemical profiling

Auteurs: Klemensas Šimelis; Hilal Saraç; Eidarus Salah; Kosuke Nishio; Tom E. McAllister; Thomas P. Corner; Anthony Tumber; Roman Belle; Christopher J. Schofield; Hiroaki Suga; Akane Kawamura
Publié dans: Bioorganic & Medicinal Chemistry, Numéro Volume 99, 2024, ISSN 0968-0896
Éditeur: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.bmc.2024.117597

Unravelling 2-oxoglutarate turnover and substrate oxidation dynamics in 5-methylcytosine-oxidising TET enzymes

Auteurs: Klemensas Šimelis, Roman Belle, Akane Kawamura
Publié dans: Communications Chemistry, Numéro 7, 2024, ISSN 2399-3669
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s42004-024-01382-1

KDM3A catalyses the oxidation of acetyl-lysine to hydroxyacetyl-lysine on histone H3K9

Auteurs: Roman Belle, John-Paul Bukowski, Rachel Schiller, Ronald Cutler, Eidarus Salah, Robert S. Dawber, Anthony Tumber, Joanna Bonnici, Jessica D. Kindrick, Loane Serrano, Patrick Rabe, Catrine Johansson, Marie-Hélène Ruchaud, Richard J. Hopkinson, William D. Figg, Sr, Paul E. Brennan, David R. Mole, Simone Sidoli, Akane Kawamura, Christopher J. Schofield
Publié dans: Nature Chemistry, Numéro 18, 2026, Page(s) 823-834, ISSN 1755-4330
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41557-026-02112-x

Cyclic β2,3-amino acids improve the serum stability of macrocyclic peptide inhibitors targeting the SARS-CoV-2 main protease

Auteurs: Takashi Miura, Tika R Malla, Lennart Brewitz, Anthony Tumber, Eidarus Salah, Kang Ju Lee, Naohiro Terasaka, C David Owen, Claire Strain-Damerell, Petra Lukacik, Martin A Walsh, Akane Kawamura, Christopher J Schofield, Takayuki Katoh, Hiroaki Suga
Publié dans: Bulletin of the Chemical Society of Japan, Numéro 97, 2024, ISSN 0009-2673
Éditeur: Chemical Society of Japan/Nippon Kagakukai
DOI: 10.1093/bulcsj/uoae018

The influence of degree of labelling upon cellular internalisation of antibody-cell penetrating peptide conjugates.

Auteurs: Toni A. Pringle; Oliver Coleman; Akane Kawamura; James C. Knight
Publié dans: RSC Advances, 2022, ISSN 1473-7604
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2ra05274a

Focused Screening Identifies Different Sensitivities of Human TET Oxygenases to the Oncometabolite 2-Hydroxyglutarate

Auteurs: Roman Belle; Hilal Saraç; Eidarus Salah; Bhaskar Bhushan; Aleksandra Szykowska; Grace Roper; Anthony Tumber; Skirmantas Kriaucionis; Nicola Burgess-Brown; Christopher J. Schofield; Tom Brown; Akane Kawamura
Publié dans: Journal of Medicinal Chemistry, Numéro 67 (6), 2024, Page(s) 4525-4540, ISSN 0022-2623
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jmedchem.3c01820

In vitro selection of macrocyclic peptide inhibitors containing cyclic γ2,4-amino acids targeting the SARS-CoV-2 main protease

Auteurs: Takashi Miura; Tika R. Malla; C. David Owen; Anthony Tumber; Lennart Brewitz; Michael A. McDonough; Eidarus Salah; Naohiro Terasaka; Takayuki Katoh; Petra Lukacik; Claire Strain-Damerell; Halina Mikolajek; Martin A. Walsh, Akane Kawamura; Christopher J. Schofield; Hiroaki Suga;
Publié dans: Nature Chemistry, 2023, ISSN 1755-4330
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41557-023-01205-1

Identification and engineering of potent cyclic peptides with selective or promiscuous binding through biochemical profiling and bioinformatic data analysis

Auteurs: Thomas P. Smith; Bhaskar Bhushan; Daniele Granata; Christian S. Kaas; Birgitte Andersen; Klaas W. Decoene; Qiansheng Ren; Haimo Liu; Xinping Qu; Yang Yang; Jia Pan; Quijia Chen; Martin Münzel; Akane Kawamura
Publié dans: RSC Chemical Biology, Numéro Volume 5, Numéro 1, 2024, Page(s) 1-64, ISSN 2633-0679
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d3cb00168g

Fragment expansion with NUDELs - poised DNA-encoded libraries

Auteurs: Catherine LA Salvini, Benoit Darlot, Jack Davison, Mathew Martin, Susan Tudhope, Shannon Turberville, Akane Kawamura, Martin EM Noble, Stephen Wedge, James John Crawford, Michael James Waring,
Publié dans: Chemical Science, 2023, ISSN 2041-6520
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d3sc01171b