Descripción del proyecto
Más información sobre la unión de los factores de transcripción regulados por HIPPO
Se han identificado más de 1 600 factores de transcripción (FT), con un papel fundamental en la expresión genética. Aunque se conoce su campo de unión, no se disponen de demasiados datos sobre la forma en que los FT interactúan con los nucleosomas y la cromatina. El objetivo de los científicos del proyecto HIPPOSTRUCT, financiado con fondos europeos, es diseccionar la interferencia entre diferentes FT de las familias TEAD y FOX implicados en la vía de señalización del supresor tumoral HIPPO. Parten de la hipótesis de que los FT FOX remodelan la cromatina para facilitar la unión de TEAD y la expresión genética. Para ello, combinarán análisis bioinformáticos para identificar los locus de unión de los FT en el genoma humano y trabajos experimentales para determinar la unión intermolecular entre los FT y el ADN.
Objetivo
Transcription factors (TFs) are proteins which recognize specific DNA-sequence to orchestrate various gene expression programs according to cellular requirements. Currently, approximately 1,600 TFs along with their binding motifs have been annotated. Further, recent studies enabled classification of many of them according to their binding modes across nucleosome assembly. Despite such progress, interplay of different TFs in the context of adjacent DNA sequence or spatial organisation of chromatin is still largely unknown. This project aims to dissect crosstalk between different TFs that are targeted by HIPPO signalling pathway, a tumour suppressor pathway representing potential target for anti-tumour therapies. Preliminary data from host lab combined with previous studies from other groups lead us to postulate hypothesis that TFs from TEAD and FOX groups cooperate on regulation of transcription programs controlled by HIPPO pathway. Specifically, FOX TFs act as chromatin re-modellers enabling TEADs binding to the naked part of DNA which then triggers desired gene expression programs. To test this hypothesis, we will combine bioinformatic searches across human genome with experimental work assessing intermolecular binding between TFs and DNA, followed by structural characterization of selected macromolecular complexes. We will identify genomic loci which contains binding motifs for both TEAD and FOX TFs. These DNA fragment will be tested experimentally in terms of their ability to physically interact with both TFs, which will provide mechanistic insight into their cooperation. Finally, 3-D structure of the reconstituted complexes containing TF pairs bound to DNA will be determined using advanced mass spectrometry combined with high-resolution structural techniques such as X-ray crystallography and cryo-electron microscopy. This project will provide insight how TFs cooperate in the relevant genomic context with physiological chromatin architecture.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias de la tierra y ciencias ambientales conexas geología mineralogía cristalografía
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- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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H2020-EU.4. - SPREADING EXCELLENCE AND WIDENING PARTICIPATION
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
MSCA-IF-EF-ST - Standard EF
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
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(se abrirá en una nueva ventana) H2020-WF-2018-2020
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
142 00 PRAHA 4
Chequia
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.