Descrizione del progetto
Informazioni preziose sul legame dei fattori di trascrizione regolati dalla via di HIPPO
Sono oltre 1 600 i fattori di trascrizione (TF, Transcription Factors) annotati che svolgono un ruolo determinante nell’espressione genica. Sebbene il loro dominio di legame sia noto, il modo in cui i TF interagiscono con i nucleosomi e la cromatina rimane scarsamente caratterizzato. Gli scienziati del progetto HIPPOSTRUCT, finanziato dall’UE, mirano a sezionare l’interazione tra diversi TF dalle famiglie TEAD e FOX, implicati nella via di segnalazione HIPPO di soppressione tumorale. I ricercatori stanno lavorando basandosi sull’ipotesi secondo cui i TF FOX rimodellano la cromatina per agevolare il legame TEAD e l’espressione genica. Per fare ciò, combineranno analisi di bioinformatica per identificare i loci di legame dei TF tra il genoma umano e il lavoro sperimentale per determinare il legame intermolecolare tra TF e DNA.
Obiettivo
Transcription factors (TFs) are proteins which recognize specific DNA-sequence to orchestrate various gene expression programs according to cellular requirements. Currently, approximately 1,600 TFs along with their binding motifs have been annotated. Further, recent studies enabled classification of many of them according to their binding modes across nucleosome assembly. Despite such progress, interplay of different TFs in the context of adjacent DNA sequence or spatial organisation of chromatin is still largely unknown. This project aims to dissect crosstalk between different TFs that are targeted by HIPPO signalling pathway, a tumour suppressor pathway representing potential target for anti-tumour therapies. Preliminary data from host lab combined with previous studies from other groups lead us to postulate hypothesis that TFs from TEAD and FOX groups cooperate on regulation of transcription programs controlled by HIPPO pathway. Specifically, FOX TFs act as chromatin re-modellers enabling TEADs binding to the naked part of DNA which then triggers desired gene expression programs. To test this hypothesis, we will combine bioinformatic searches across human genome with experimental work assessing intermolecular binding between TFs and DNA, followed by structural characterization of selected macromolecular complexes. We will identify genomic loci which contains binding motifs for both TEAD and FOX TFs. These DNA fragment will be tested experimentally in terms of their ability to physically interact with both TFs, which will provide mechanistic insight into their cooperation. Finally, 3-D structure of the reconstituted complexes containing TF pairs bound to DNA will be determined using advanced mass spectrometry combined with high-resolution structural techniques such as X-ray crystallography and cryo-electron microscopy. This project will provide insight how TFs cooperate in the relevant genomic context with physiological chromatin architecture.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
- scienze naturali scienze della terra e scienze ambientali connesse geologia mineralogia cristallografia
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze naturali scienze chimiche chimica analitica spettrometria di massa
- scienze naturali scienze biologiche genetica genomi
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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H2020-EU.4. - SPREADING EXCELLENCE AND WIDENING PARTICIPATION
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
MSCA-IF-EF-ST - Standard EF
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) H2020-WF-2018-2020
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
142 00 PRAHA 4
Cechia
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.