MOlecular-Scale Biophysics Research Infrastructure

Informations projet

MOSBRI

N° de convention de subvention: 101004806

DOI

10.3030/101004806

Date de signature de la CE 16 Mars 2021

Date de début 1 Juillet 2021

Date de fin 31 Octobre 2025

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - Research Infrastructures

Coût total

€ 4 996 058,14

Contribution de l’UE

€ 4 996 058,00

Coordonné par

INSTITUT PASTEUR
France

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Websites, patent fillings, videos etc. (4)

Dissemination of novel methodologies via website

Dissemination of novel methodologies via websiteDeliverable to be submitted in M12 M24 and M48

Operational proposal system based on ARIA cloud service
Driving licence specifications and test materials at Operator level
MOSBRI website

Documents, reports (5)

Report on joint events organized with ARBRE and EBSA

Report on joint events organized with ARBRE and EBSADeliverable to be submitted in M18 M30 and M42

Analysis of the mapping of the needs for data standards/formats

Analysis of the mapping of the needs for data standardsformats

Established reference calibration samples
Analysis of the mapping of the needs for repository/database

Analysis of the mapping of the needs for repositorydatabase

Report on joint events organized with INSTRUCT

Report on joint events organized with INSTRUCTDeliverable to be submitted in M18 M30 and M42

Other (1)

Setting-up of a TNA moderator panel and of a TNA reviewer panel

Publications

Peer reviewed articles (34)

Interaction of a Histidine-Rich Antimicrobial Saliva Peptide with Model Cell Membranes: The Role of Histidines

Auteurs: Skog, A. E., Corucci, G., Tully, M. D., Fragneto, G., Gerelli, Y., Skepö, M.
Publié dans: Langmuir, Numéro 39, 2023, Page(s) 7694, ISSN 1520-5827
Éditeur: ACS Publications
DOI: 10.1021/acs.langmuir.3c00498

Temoneira-1 beta-lactamase is not a metalloenzyme, but its native metal ion binding sites allow for purification by immobilized metal ion affinity chromatography

Auteurs: Nafaee, Z.H., Hunyadi-Gulyas, E., Gyurcsik, B.
Publié dans: Protein Expression and Purification, 2023, ISSN 1046-5928
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.pep.2022.106169

Structure and conformational variability of the HER2-trastuzumab-pertuzumab complex

Auteurs: Ruedas, R., Vuillemot, R., Tubiana, T., Winter, J. M., Pieri, L., Arteni, A.-A., Samson, C., Jonic, S., Mathieu, M., Bressanelli, S.
Publié dans: Journal of Structural Biology, 2024, ISSN 1047-8477
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jsb.2024.108095

The phosphodiesterase RmcA contributes to the adaptation of Pseudomonas putida to l-arginine

Auteurs: Scribani-Rossi C, Molina-Henares MA, Angeli S, Cutruzzolà F, Paiardini A, Espinosa-Urgel M, Rinaldo S.
Publié dans: FEMS Microbiology Letters, Numéro Volume 370, 2023, ISSN 1574-6968
Éditeur: Oxford university press
DOI: 10.1093/femsle/fnad077

Electrochemical Kinetics Support a Second Coordination Sphere Mechanism in Metal-Based Formate Dehydrogenase

Auteurs: Marta Meneghello, Alexandre Uzel, Marianne Broc, Rita R. Manuel, Axel Magalon, Christophe Léger, Inês A. C. Pereira, Anne Walburger, Vincent Fourmond
Publié dans: Angewandte Chemie - International edition, Numéro 134, e202299999, 2022, ISSN 1521-3773
Éditeur: Wiley-VCH GmbH
DOI: 10.1002/anie.202212224

Visualizing Molecular Dynamics by High-Speed Atomic Force Microscopy

Auteurs: van Ewijk, C., Maity, S., Roos, W.H.
Publié dans: Single Molecule Analysis . Methods in Molecular Biology, 2023, ISSN 1064-3745
Éditeur: Humana Press, Inc.
DOI: 10.1007/978-1-0716-3377-9_17

Interactions and Insertion of Escherichia coli Hfq into Outer Membrane Vesicles as Revealed by Infrared and Orientated Circular Dichroism Spectroscopies

Auteurs: Turbant, F., Waeytens, J., Blache, A., Esnouf, E., Raussens, V., Wegrzyn, G., Achouak, W., Wien, F., Arluison, V.
Publié dans: International Journal of Molecular Sciences, Numéro 24(14), 11424, 2023, ISSN 1422-0067
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms241411424

Despite the odds: formation of the SARS-CoV-2 methylation complex

Auteurs: Matsuda, A., Plewka, J., Rawski, M., Mourão, A., Zajko, W., Siebenmorgen, T., Kresik, L., Lis, K., Jones, A. N., Pachota, M., Karim, A., Hartman, K., Nirwal, S., Sonani, R., Chykunova,Y., Minia, I., Mak, P., Landthaler, M., Nowotny, M., Dubin, G., Sattler, M., Suder, P., Popowicz, G. M., Pyrć, K., Czarna, A.
Publié dans: Nucleic Acids Research, 2024, ISSN 1362-4962
Éditeur: Oxford university press
DOI: 10.1093/nar/gkae165

Lateral membrane organization as target of an antimicrobial peptidomimetic compound

Auteurs: Melcrova, A., Maity, S., Melcr, J., de Kok, N.A.W., Gabler, M., van der Eyden, J., Stensen, W., Svendsen, J.S.M., Driessen, A.J.M., Marrink, S.J., Roos, W.H.
Publié dans: Nature Communications, Numéro 14(1) ar4038, 2023, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-39726-5

Influence of the enzymatic treatment and pH on the interfacial and emulsifying properties of sunflower and olive protein hydrolysates

Auteurs: Pérez-Gálvez, R., Maldonado-Valderrama, J., Jones, N. C., Hoffmann, S. V., Guadix, E., García-Moreno, P. J.
Publié dans: Food Hydrocolloids, Numéro 154 ar110135, 2024, ISSN 0268-005X
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.foodhyd.2024.110135

13th EBSA congress, July 24–28, 2021, Vienna, Austria

Auteurs: 13th EBSA congress
Publié dans: European Biophysics Journal, Numéro 50/S1, 2021, Page(s) 1-226, ISSN 0175-7571
Éditeur: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00249-021-01558-w

ATR-FTIR Biosensors for Antibody Detection and Analysis

Auteurs: Suys, O., Derenne, A., Goormaghtigh, E.
Publié dans: International Journal of Molecular Sciences, Numéro 23(19), 2022, Page(s) 11895, ISSN 1422-0067
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms231911895

Biochemical characterization of L-asparaginase isoforms from Rhizobium etli—the boosting effect of zinc

Auteurs: Sliwiak, J., Worsztynowicz, P., Pokrywka, K., Loch, J. I., Grzechowiak, M., Jaskolski, M.
Publié dans: Frontiers in Chemistry, 2024, ISSN 2296-2646
Éditeur: Frontiers Media S.A
DOI: 10.3389/fchem.2024.1373312

Protein Structural Denaturation Evaluated by MCR-ALS of Protein Microarray FTIR Spectra

Auteurs: De Meutter, J., Goormaghtigh, E.
Publié dans: Analytical Chemistry, Numéro 93(40), 2021, Page(s) 13441-13449, ISSN 1520-6882
Éditeur: American Chemical Society publications
DOI: 10.1021/acs.analchem.1c01416

Molecular insights into RmcA-mediated c-di-GMP consumption: Linking redox potential to biofilm morphogenesis in Pseudomonas aeruginosa

Auteurs: Scribani Rossi, C., Eckartt, K., Scarchilli, E., Angeli, S., Price-Whelan, A., Di Matteo, A., Chevreuil, M., Raynal, B., Arcovito, A., Giacon, N., Fiorentino, F., Rotili, D.,
Publié dans: Microbiological Research, Numéro Volume 277, 127498, 2023, ISSN 1618-0623
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.micres.2023.127498

Synthesis of 3,4-Disubstituted Pyrroline Nitroxides Containing Diphenylphosphane or Diphenylphosphane Oxide Substituents

Auteurs: Balázsi, A., Bognár, B., Jeko, J., Kálai, T.
Publié dans: SynOpen, 2024, ISSN 2509-9396
Éditeur: Thieme
DOI: 10.1055/a-2264-8302

Raynals, an online tool for the analysis of dynamic light scattering.

Auteurs: Burastero, O., Draper-Barr, G., Raynal, B., Chevreuil, M., England, P., Garcia-Alai, M.
Publié dans: Acta Crystallographica Section D, Numéro 79, 2023, Page(s) p673–683, ISSN 2059-7983
Éditeur: IUCr journals
DOI: 10.1107/s2059798323004862

Exploring the Metabolic Response of Pseudomonas putida to L-arginine

Auteurs: Scribani-Rossi, C., Molina-Henares, M. A., Espinosa-Urgel, M., Rinaldo, S.
Publié dans: Advances in Experimental Medicine and Biology, 2024, ISSN 0065-2598
Éditeur: Kluwer Academic/Plenum Publishers
DOI: 10.1007/5584_2024_797

Limited high-throughput screening compatibility of the phenuivirus cap-binding domain

Auteurs: Scherf, J., Vogel, D., Gul, S., Reinshagen, J., Gribbon, P., Rosenthal, M.
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 13, 2023, Page(s) 22820, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-023-50158-5

Guidelines for the Simulations of Nitroxide X-Band cw EPR Spectra from Site-Directed Spin Labeling Experiments Using SimLabel

Auteurs: Etienne, E., Pierro, A., Tamburrini, K. C., Bonucci, A., Mileo, E., Martinho, M., Belle, V.
Publié dans: Molecules, Numéro 28, 2023, Page(s) 1348, ISSN 1420-3049
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/molecules28031348

Effect of Cholesterol on Biomimetic Membrane Curvature and Coronavirus Fusion Peptide Encapsulation

Auteurs: Milogrodzka, I., Pham, D.T.N., Sama, G.R., Samadian, H., Zhai, J.L., de Campo, L., Kirby, N.M., Scott, T.F., Holl, M.M.B., van’t Hag, L.
Publié dans: ACS Nano, Numéro 17 (9), 2023, Page(s) 8598-8612, ISSN 1936-0851
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acsnano.3c01095

In-cell investigation of the conformational landscape of the GTPase UreG by SDSL-EPR

Auteurs: Pierro, A., Tamburrini, K.C., Leguenno, H., Gerbaud, G., Etienne, E., Guigliarelli, B., Belle, V., Zambelli, B., Mileo, E.
Publié dans: iScience, Numéro 26(10), 2023, Page(s) 107855, ISSN 2589-0042
Éditeur: cell press
DOI: 10.1016/j.isci.2023.107855

Conformational analysis of membrane-proximal segments of GDAP1 in a lipidic environment using synchrotron radiation suggests a mode of assembly at the mitochondrial outer membrane

Auteurs: Sutinen, A., Jones, N. C., Hoffmann, S. V., Ruskamo, S., & Kursula, P.
Publié dans: Biophysical Chemistry, Numéro 303, 107113, 2023, ISSN 0301-4622
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.bpc.2023.107113

The Amyloid Assembly of the Bacterial Hfq Is Lipid-Driven and Lipid-Specific

Auteurs: Turbant, F., Machiels, Q., Waeytens, J., Wien, F., Arluison, V.
Publié dans: International Journal of Molecular Sciences, 2024, ISSN 1422-0067
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms25031434

Structural insights into the semiquinone form of human Cytochrome P450 reductase by DEER distance measurements between a native flavin and a spin labelled non-canonical amino acid

Auteurs: Bizet, M., Byrne, D., Biaso, F., Gerbaud, G., Etienne, E., Briola, G., Guigliarelli, B., Urban, P., Dorlet, P., Kalai, T., Truan, G., Martinho, M.
Publié dans: Chemistry – A European Journal,, Numéro 30 e202304307, 2024, ISSN 0947-6539
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/chem.202304307

Pea and soy protein isolate fractal gels: the role of protein composition, structure and solubility on their gelation behaviour

Auteurs: Tiong, A. Y. J., Crawford, S., Jones, N. C., McKinley, G., Batchelor, W., Hag, L. van ’t
Publié dans: Food Structure, 2024, ISSN 2213-3291
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.foostr.2024.100374

Molecular dynamics simulations of the adsorption of an intrinsically disordered protein: Force field and water model evaluation in comparison with experiments

Auteurs: Mona Koder Hamid, Linda K. Månsson, Viktoriia Meklesh, Per Persson and Marie Skepö
Publié dans: Frontiers in Molecular Biosciences, Numéro 26 October 2022, 2022, ISSN 2296-889X
Éditeur: Frontiers Media S.A.
DOI: 10.3389/fmolb.2022.958175

Conserved intramolecular networks in GDAP1 are closely connected to CMT-linked mutations and protein stability

Auteurs: Sutinen, A., Paffenholz, D., Nguyen, G.T.T., Ruskamo, S., Torda, A.E., Kursula, P.
Publié dans: plos One, Numéro 18(4) e0284532, 2023, ISSN 1932-6203
Éditeur: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pone.0284532

Chiroptical properties of membrane glycerophospholipids and their chiral backbones

Auteurs: Bocková, J., Garcia, A. D., Jones, N. C., Hoffmann, S. V., Meinert, C.
Publié dans: Chirality, Numéro 36(3), e23654, 2024, ISSN 0899-0042
Éditeur: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/chir.23654

Fluorescence labeling methods influence the aggregation process of α-syn in vitro differently

Auteurs: Jadavi, S., Dante, S., Civiero, L., Sandre, M., Bubacco, L., Tosatto, L., Bianchini, P., Canale, C., Diaspro, A.
Publié dans: Nanoscale, Numéro 15, 2023, Page(s) 8270, ISSN 2040-3372
Éditeur: royal society of chemistry
DOI: 10.1039/d2nr05487f

The human TRPA1 intrinsic cold and heat sensitivity involves separate channel structures beyond the N-ARD domain

Auteurs: Lavanya Moparthi, Viktor Sinica, Vamsi K. Moparthi, Mohamed Kreir, Thibaut Vignane, Milos R. Filipovic, Viktorie Vlachova & Peter M. Zygmunt
Publié dans: Nature communications, Numéro 13:6113, 17 October 2022, 2022, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-33876-8

Antimicrobial Activity of an Fmoc-Plantaricin 149 Derivative Peptide against Multidrug-Resistant Bacteria.

Auteurs: Righetto, G.M.; Lopes, J.L.d.S.; Bispo, P.J.M.; André, C.; Souza, J.M.; Andricopulo, A.D.; Beltramini, L.M.; Camargo, I.L.B.d.C.
Publié dans: Anitbiotics, Numéro 12, 2023, Page(s) 391, ISSN 2079-6382
Éditeur: MDPI
DOI: 10.3390/antibiotics12020391

Advantages of a synchrotron light source for fluorescence-detected linear dichroism

Auteurs: Jones, N. C., Rodger, A., Hoffmann, S. V.
Publié dans: Chirality, Numéro 36(4) e23667, 2024, ISSN 0899-0042
Éditeur: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/chir.23667

An allosteric redox switch involved in oxygen protection in a CO2 reductase

Auteurs: Oliveira, A.R., Mota, C., Vilela-Alves, G., Manuel, R.R., Pedrosa, N., Fourmond, V., Klymanska, K., Léger, C., Guigliarelli, B., Romão, M.J., Pereira, I.A.C.
Publié dans: Nature Chemical Biology, Numéro 20, 111-119, 2024, ISSN 1465-7392
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41589-023-01484-2

Conference proceedings (8)

Thermodynamic landscape of the redox-centres in the electron-confurcating [FeFe]-Hydrogenase (HydABC) of Thermotoga maritima

Auteurs: Kilian Zuchan, Wolfgang Nitschke, Frauke Baymann, Nina Breuer, James Birell
Publié dans: Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics, Numéro Volume 1863, Supplement, 29, 2022, Page(s) 55, ISSN 0005-2728
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.bbabio.2022.148757

MOSBRI- A New European Research Infrastructure for Molecular Biophysics

Auteurs: Pierre Dorlet, Guillaume Gerbaud, Emilien Etienne, Stéphane Grimaldi, Bruno Guigliarelli, Valérie Belle.
Publié dans: Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics, Numéro Volume 1863, Supplement 29, 2022, Page(s) 28, ISSN 0005-2728
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.bbabio.2022.148684

NAD(H)-induced flavosemiquinone stabilization in the electron-confurcating [FeFe]-Hydrogenase (HydABC) of Thermotoga maritima

Auteurs: Kilian Zuchan, Wolfgang Nitschke, Frauke Baymann, Nina Breuer, James Birell
Publié dans: Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics, Numéro Volume 1863, Supplement, 29, 2022, Page(s) 55, ISSN 0005-2728
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.bbabio.2022.148758

TNA: Apply for access to laboratories of excellence in molecular scale biophysics research infrastructure (MOSBRI)

Auteurs: Hoffmann, S., Jones, N., Raynal, B., Von Castelmur, E., Derbyshire, D., Sunnerhagen, M.
Publié dans: Acta Crystallographica A – Foundation and Advances, Numéro 78 E350-E350, 2022, ISBN 9780190080112
Éditeur: John Wiley & Sons
DOI: 10.1107/s2053273322093810

4th EBSA congress, July 31 – August 4, 2023, Stockholm, Sweden. Abstract: The MOlecular-Scale Biophysics Research Infrastructure (MOSBRI): a transnational initiative to structure and consolidate the European molecular biophysics community

Auteurs: England, P.
Publié dans: European Biophysics Journal with Biophysical Letters, Numéro 52 S178-S178, 2023
Éditeur: Springer Nature
DOI: 10.1007/s00249-023-01668-7

Advanced in-house X-ray diffraction and scattering instruments as a service for structural biology

Auteurs: Stransky, J., Pavlicek, J., Dohnalek, J.
Publié dans: 2023
Éditeur: John Wiley & Sons
DOI: 10.1107/s2053273322093111

EPR-MRS site: EPR spectroscopy for the study of biomolecules

Auteurs: Pierre Dorlet, Guillaume Gerbaud, Emilien Etienne, Stéphane Grimaldi, Bruno Guigliarelli, Valérie Belle
Publié dans: Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics, Numéro Volume 1863, Supplement 29, 2022, Page(s) 29, ISSN 0005-2728
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.bbabio.2022.148685

Spectroscopic insights into the mechanism of anamox hydrazine synthase

Auteurs: Wouter Versantvoort, Rainer Hienerwader, Christina Ferousi, Catherine Berthomieu, Laura van Niftrik, Frauke Baymann
Publié dans: Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics, Numéro Volume 1863, Supplement, 29, 2022, Page(s) 76, ISSN 0005-2728
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.bbabio.2022.148818