Descripción del proyecto
La función de las interacciones topológicas en la biología cromosómica
Las interacciones topológicas entre segmentos de ADN distantes son fundamentales para la función del genoma eucariota. La Hi-C es una técnica de captura de la conformación cromosómica que proporciona información sobre la organización tridimensional del genoma. La técnica Hi-C sensible a las cromátidas hermanas (scsHi-C, por sus siglas en inglés) desarrollada recientemente, demostró potencial para dilucidar los mecanismos por los cuales la conformación de las cromátidas hermanas controla la reparación del ADN, la regulación génica y la segregación de los cromosomas mitóticos. El proyecto TopoGenomics, financiado con fondos europeos, tiene como objetivo desarrollar la tecnología scsHi-C de próxima generación para obtener mapas de conformación de cromátidas hermanas del genoma completo de alta resolución y establecer un marco computacional basado en aprendizaje automático para detectar las estructuras topológicas en cromátidas hermanas. El proyecto mejorará la comprensión de la interacción topológica de las cromátidas hermanas para respaldar el mantenimiento, la expresión y la segregación de los genomas eucariotas.
Objetivo
Topological interactions between distant DNA segments play fundamental roles in the function of eukaryotic genomes. While tremendous progress has been made in understanding the molecular mechanisms shaping intramolecular chromosome loop structures, limitations in our ability to distinguish specific chromosome conformations between paired molecules has hindered research into the role of interactions across separate chromosomal DNA molecules. Our recent development of an approach allowing analysis of contacts between sister chromatids now provides an opportunity for research into topological interactions to enter a new phase. Initial analyses with sister chromatid-sensitive Hi-C (scsHi-C) have indicated enormous potential to elucidate the mechanisms by which sister-chromatid conformation controls processes as varied as DNA repair, gene regulation and the segregation of mitotic chromosomes. To fulfil this potential, we will now develop next-generation scsHi-C technology to generate high-resolution genome-wide conformation maps of sister chromatids, along with the establishment of a machine learning-based computational framework to systematically detect topological structures in sister chromatids. This will be complemented with an imaging-based super-resolution approach to trace sister-chromatid fibers in thousands of individual cells. These core advances will allow us to map distinct sister-chromatid contact domains and identify associated molecular signatures, understand how loop-extruding and cohesive cohesin interact to shape replicated chromosomes, and determine how epigenetic modifications control pairing between sister chromatids. Together, these developments will allow us to make key advances in understanding a fundamental yet largely neglected aspect of chromosome biologyhow replicated sister chromatids topologically interact to support maintenance, expression, and segregation of eukaryotic genomes.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo.
La clasificación de este proyecto ha sido validada por su equipo.
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo.
La clasificación de este proyecto ha sido validada por su equipo.
Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
ERC-ADG - Advanced Grant
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2020-ADG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
1030 WIEN
Austria
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.