Topological interactions as functional regulators of the eukaryotic genome: moving beyond intramolecular looping

Información del proyecto

TopoGenomics

Identificador del acuerdo de subvención: 101019039

DOI

10.3030/101019039

Fecha de la firma de la CE 13 Agosto 2021

Fecha de inicio 1 Septiembre 2021

Fecha de finalización 31 Agosto 2026

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 2 792 500,00

Aportación de la UE

€ 2 792 500,00

Coordinado por

INSTITUT FUER MOLEKULARE BIOTECHNOLOGIE GMBH
Austria

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Publicaciones

Peer reviewed articles (5)

HiCognition: a visual exploration and hypothesis testing tool for 3D genomics

Autores: Christoph C. H. Langer, Michael Mitter, Roman R. Stocsits, Daniel W. Gerlich
Publicado en: Genome Biology, 2023, ISSN 1474-7596
Editor: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13059-023-02996-9

Sister chromatid cohesion is mediated by individual cohesin complexes

Autores: Fena Ochs, Charlotte Green, Aleksander Tomasz Szczurek, Lior Pytowski, Sofia Kolesnikova, Jill Brown, Daniel Wolfram Gerlich, Veronica Buckle, Lothar Schermelleh, Kim Ashley Nasmyth
Publicado en: Science, 2024, ISSN 0036-8075
Editor: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.adl4606

Cohesin-mediated DNA loop extrusion resolves sister chromatids in G2 phase

Autores: Paul Batty, Christoph C.H. Langer, Zsuzsanna Takács, Wen Tang, Claudia Blaukopf, Jan-Michael Peters, Daniel W. Gerlich
Publicado en: The EMBO Journal, 2023, ISSN 0261-4189
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embj.2023113475

Sister chromatid-sensitive Hi-C to map the conformation of replicated genomes

Autores: Mitter M, Takacs Z, Köcher T, Micura R, Langer CCH, Gerlich DW.
Publicado en: Nature Protocols, Edición 2022 Jun;17(6), 2022, ISSN 1750-2799
Editor: NPG
DOI: 10.1038/s41596-022-00687-6

Cohesin mediates DNA loop extrusion and sister chromatid cohesion by distinct mechanisms

Autores: Kota Nagasaka, Iain F. Davidson, Roman R. Stocsits, Wen Tang, Gordana Wutz, Paul Betty, Melanie Panarotto, Gabriele Litos, Alexander Schleiffer, Daniel Wolfram Gerlich, Jan-Michael Peters
Publicado en: Molecular Cell, 2022, ISSN 1097-2765
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2023.07.024