Topological interactions as functional regulators of the eukaryotic genome: moving beyond intramolecular looping

Informations projet

TopoGenomics

N° de convention de subvention: 101019039

DOI

10.3030/101019039

Date de signature de la CE 13 Août 2021

Date de début 1 Septembre 2021

Date de fin 31 Août 2026

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 2 792 500,00

Contribution de l’UE

€ 2 792 500,00

Coordonné par

INSTITUT FUER MOLEKULARE BIOTECHNOLOGIE GMBH
Austria

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Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Publications

Peer reviewed articles (5)

HiCognition: a visual exploration and hypothesis testing tool for 3D genomics

Auteurs: Christoph C. H. Langer, Michael Mitter, Roman R. Stocsits, Daniel W. Gerlich
Publié dans: Genome Biology, 2023, ISSN 1474-7596
Éditeur: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13059-023-02996-9

Sister chromatid cohesion is mediated by individual cohesin complexes

Auteurs: Fena Ochs, Charlotte Green, Aleksander Tomasz Szczurek, Lior Pytowski, Sofia Kolesnikova, Jill Brown, Daniel Wolfram Gerlich, Veronica Buckle, Lothar Schermelleh, Kim Ashley Nasmyth
Publié dans: Science, 2024, ISSN 0036-8075
Éditeur: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.adl4606

Cohesin-mediated DNA loop extrusion resolves sister chromatids in G2 phase

Auteurs: Paul Batty, Christoph C.H. Langer, Zsuzsanna Takács, Wen Tang, Claudia Blaukopf, Jan-Michael Peters, Daniel W. Gerlich
Publié dans: The EMBO Journal, 2023, ISSN 0261-4189
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embj.2023113475

Sister chromatid-sensitive Hi-C to map the conformation of replicated genomes

Auteurs: Mitter M, Takacs Z, Köcher T, Micura R, Langer CCH, Gerlich DW.
Publié dans: Nature Protocols, Numéro 2022 Jun;17(6), 2022, ISSN 1750-2799
Éditeur: NPG
DOI: 10.1038/s41596-022-00687-6

Cohesin mediates DNA loop extrusion and sister chromatid cohesion by distinct mechanisms

Auteurs: Kota Nagasaka, Iain F. Davidson, Roman R. Stocsits, Wen Tang, Gordana Wutz, Paul Betty, Melanie Panarotto, Gabriele Litos, Alexander Schleiffer, Daniel Wolfram Gerlich, Jan-Michael Peters
Publié dans: Molecular Cell, 2022, ISSN 1097-2765
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2023.07.024