Topological interactions as functional regulators of the eukaryotic genome: moving beyond intramolecular looping

Projektinformationen

TopoGenomics

ID Finanzhilfevereinbarung: 101019039

DOI

10.3030/101019039

EK-Unterschriftsdatum 13 August 2021

Startdatum 1 September 2021

Enddatum 31 August 2026

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 2 792 500,00

EU-Beitrag

€ 2 792 500,00

Koordiniert durch

INSTITUT FUER MOLEKULARE BIOTECHNOLOGIE GMBH
Austria

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (5)

HiCognition: a visual exploration and hypothesis testing tool for 3D genomics

Autoren: Christoph C. H. Langer, Michael Mitter, Roman R. Stocsits, Daniel W. Gerlich
Veröffentlicht in: Genome Biology, 2023, ISSN 1474-7596
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13059-023-02996-9

Sister chromatid cohesion is mediated by individual cohesin complexes

Autoren: Fena Ochs, Charlotte Green, Aleksander Tomasz Szczurek, Lior Pytowski, Sofia Kolesnikova, Jill Brown, Daniel Wolfram Gerlich, Veronica Buckle, Lothar Schermelleh, Kim Ashley Nasmyth
Veröffentlicht in: Science, 2024, ISSN 0036-8075
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.adl4606

Cohesin-mediated DNA loop extrusion resolves sister chromatids in G2 phase

Autoren: Paul Batty, Christoph C.H. Langer, Zsuzsanna Takács, Wen Tang, Claudia Blaukopf, Jan-Michael Peters, Daniel W. Gerlich
Veröffentlicht in: The EMBO Journal, 2023, ISSN 0261-4189
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embj.2023113475

Sister chromatid-sensitive Hi-C to map the conformation of replicated genomes

Autoren: Mitter M, Takacs Z, Köcher T, Micura R, Langer CCH, Gerlich DW.
Veröffentlicht in: Nature Protocols, Ausgabe 2022 Jun;17(6), 2022, ISSN 1750-2799
Herausgeber: NPG
DOI: 10.1038/s41596-022-00687-6

Cohesin mediates DNA loop extrusion and sister chromatid cohesion by distinct mechanisms

Autoren: Kota Nagasaka, Iain F. Davidson, Roman R. Stocsits, Wen Tang, Gordana Wutz, Paul Betty, Melanie Panarotto, Gabriele Litos, Alexander Schleiffer, Daniel Wolfram Gerlich, Jan-Michael Peters
Veröffentlicht in: Molecular Cell, 2022, ISSN 1097-2765
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2023.07.024